In Silico Identification of Stress-Associated Transposable Elements in Arabidopsis thaliana Using Public Transcriptome Data.

Eskier, Doga; Karakülah, Gökhan

Eskier, Doga; Karakülah, Gökhan.

Afiliación

Eskier D; Izmir International Biomedicine and Genome Institute (iBG-Izmir), Dokuz Eylül University, Inciralti, Izmir, Turkey.
Karakülah G; Izmir Biomedicine and Genome Center (IBG), Inciralti, Izmir, Turkey.

Methods Mol Biol ; 2250: 15-30, 2021.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33900589

Asunto(s)

Arabidopsis/genética; Biología Computacional/métodos; Elementos Transponibles de ADN; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Simulación por Computador; Bases de Datos Genéticas; Regulación de la Expresión Génica de las Plantas; Anotación de Secuencia Molecular; Estrés Salino; Análisis de Secuencia de ARN; Transcriptoma

Palabras clave

Bioinformatics; Plant genome; Public databases; RNA-seq; Stress response; Transcriptomics; Transposable elements

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Texto completo: 1 Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Elementos Transponibles de ADN / Arabidopsis / Biología Computacional / Perfilación de la Expresión Génica Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Turquía

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