RESUMO
The epidermal growth factor (EGF) repeat superfamily of genes often encodes proteins that govern cellular proliferative responses. Using a high-throughput screening by hybridization approach, a novel human EGF repeat superfamily member that maps to human chromosome X was identified. Termed EGFL6, the gene encodes a predicted signal peptide, suggesting that it is secreted. Other predicted features include four and one-half EGF-like repeat domains, two N-linked glycosylation sites, an integrin association motif (RGD), and a tyrosine phosphorylation site. Importantly, its transcripts are expressed in brain and lung tumor and fetal tissues, but are generally absent from normal adult tissues. Implications with respect to cell cycle regulation and oncogenesis are discussed.
Assuntos
Fator de Crescimento Epidérmico/genética , Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento , Regulação Neoplásica da Expressão Gênica , Glicoproteínas/biossíntese , Glicoproteínas/genética , Proteínas de Neoplasias/biossíntese , Proteínas de Neoplasias/genética , Neoplasias/genética , Peptídeos , Sequências Repetitivas de Aminoácidos/genética , Adulto , Sequência de Aminoácidos , Sequência de Bases , Proteínas de Ligação ao Cálcio , Moléculas de Adesão Celular , Clonagem Molecular , Feminino , Feto , Biblioteca Gênica , Glicoproteínas/isolamento & purificação , Humanos , Masculino , Glicoproteínas de Membrana , Pessoa de Meia-Idade , Dados de Sequência Molecular , Família Multigênica , Proteínas de Neoplasias/isolamento & purificação , Hibridização de Ácido Nucleico , Especificidade de Órgãos/genéticaRESUMO
Interleukin-1 is a potent mediator of inflammation, involved in regulating a wide variety of physiological and cellular events. We have identified and characterized a novel member of the human interleukin-1 gene family (IL1HY1). The encoded protein demonstrates significant amino acid homology to the receptor antagonist (IL-1ra) at 52%. The gene was mapped to the long arm of chromosome 2, in close proximity to the IL-1 locus. IL1HY1 message is tightly regulated being most predominantly expressed in the skin, but also detected in the spleen, brain leukocyte, and macrophage cell types. Furthermore, the message can be induced in THP-1 cells by phorbol ester (PMA) and lipopolysaccharide (LPS) treatment.
Assuntos
Cromossomos Humanos Par 2 , Interleucinas , Proteínas/genética , Receptores de Interleucina-1/antagonistas & inibidores , Pele/imunologia , Sequência de Aminoácidos , Sequência de Bases , Encéfalo/imunologia , Linhagem Celular , Mapeamento Cromossômico , Feto , Amplificação de Genes , Biblioteca Gênica , Humanos , Proteína Antagonista do Receptor de Interleucina 1 , Leucócitos/imunologia , Macrófagos/imunologia , Dados de Sequência Molecular , Família Multigênica , Especificidade de Órgãos , Proteínas/química , RNA Mensageiro/genética , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Alinhamento de Sequência , Homologia de Sequência de Aminoácidos , Sialoglicoproteínas/química , Sialoglicoproteínas/genética , Pele/embriologia , Baço/imunologia , Transcrição GênicaRESUMO
Hereditary haemochromatosis (HH), which affects some 1 in 400 and has an estimated carrier frequency of 1 in 10 individuals of Northern European descent, results in multi-organ dysfunction caused by increased iron deposition, and is treatable if detected early. Using linkage-disequilibrium and full haplotype analysis, we have identified a 250-kilobase region more than 3 megabases telomeric of the major histocompatibility complex (MHC) that is identical-by-descent in 85% of patient chromosomes. Within this region, we have identified a gene related to the MHC class I family, termed HLA-H, containing two missense alterations. One of these is predicted to inactivate this class of proteins and was found homozygous in 83% of 178 patients. A role of this gene in haemochromatosis is supported by the frequency and nature of the major mutation and prior studies implicating MHC class I-like proteins in iron metabolism.
Assuntos
Antígenos HLA/genética , Hemocromatose/genética , Antígenos de Histocompatibilidade Classe I/genética , Proteínas de Membrana , Alelos , Sequência de Aminoácidos , Sequência de Bases , Evolução Biológica , Cromossomos Artificiais de Levedura , Cromossomos Humanos Par 6 , Clonagem Molecular/métodos , Cisteína , Primers do DNA/química , Expressão Gênica , Genes MHC Classe I , Marcadores Genéticos , Haplótipos , Proteína da Hemocromatose , Humanos , Desequilíbrio de Ligação , Complexo Principal de Histocompatibilidade , Dados de Sequência Molecular , RNA Mensageiro/genética , Alinhamento de Sequência , Homologia de Sequência de AminoácidosRESUMO
A genetic map of highly polymorphic microsatellite markers spanning the von Hippel-Lindau region (VHL) of 3p25 was constructed using the CEPH reference pedigrees. A greater than 1000:1 odds map of pter-D3S1038-RAF1-D3S651-D3S656-D3S110- D3S1255-cen was found. Genotyping of six multigenerational VHL families showed the region surrounding the D3S1038 marker to be the most likely location for the VHL gene with a peak location score of 10.04 with VHL completely linked to D3S1038. These data provide an initial high resolution genetic map of this region; D3S1038 appears to be a highly polymorphic marker that should prove useful in the future for presymptomatic diagnosis.