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Biochemistry ; 56(41): 5560-5569, 2017 10 17.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28952717

RESUMO

Intrinsic disorder is a major structural category in biology, accounting for more than 30% of coding regions across the domains of life, yet consists of conformational ensembles in equilibrium, a major challenge in protein chemistry. Anciently evolved papillomavirus genomes constitute an unparalleled case for sequence to structure-function correlation in cases in which there are no folded structures. E7, the major transforming oncoprotein of human papillomaviruses, is a paradigmatic example among the intrinsically disordered proteins. Analysis of a large number of sequences of the same viral protein allowed for the identification of a handful of residues with absolute conservation, scattered along the sequence of its N-terminal intrinsically disordered domain, which intriguingly are mostly leucine residues. Mutation of these led to a pronounced increase in both α-helix and ß-sheet structural content, reflected by drastic effects on equilibrium propensities and oligomerization kinetics, and uncovers the existence of local structural elements that oppose canonical folding. These folding relays suggest the existence of yet undefined hidden structural codes behind intrinsic disorder in this model protein. Thus, evolution pinpoints conformational hot spots that could have not been identified by direct experimental methods for analyzing or perturbing the equilibrium of an intrinsically disordered protein ensemble.


Assuntos
Papillomavirus Humano 16/metabolismo , Proteínas Intrinsicamente Desordenadas/química , Modelos Moleculares , Proteínas E7 de Papillomavirus/química , Sequência de Aminoácidos , Substituição de Aminoácidos , Sequência de Bases , Sequência Conservada , DNA Viral/química , DNA Viral/metabolismo , Deleção de Genes , Concentração de Íons de Hidrogênio , Proteínas Intrinsicamente Desordenadas/genética , Proteínas Intrinsicamente Desordenadas/metabolismo , Leucina/química , Mutagênese Sítio-Dirigida , Proteínas E7 de Papillomavirus/genética , Proteínas E7 de Papillomavirus/metabolismo , Fragmentos de Peptídeos/química , Fragmentos de Peptídeos/genética , Fragmentos de Peptídeos/metabolismo , Mutação Puntual , Conformação Proteica , Conformação Proteica em alfa-Hélice , Conformação Proteica em Folha beta , Dobramento de Proteína , Estabilidade Proteica , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Alinhamento de Sequência
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