RESUMO
BACKGROUND: Molecular alterations occur frequently in T-ALL and the potential impact of those abnormalities on outcome is still controversial. The current study aimed to test whether NOTCH1 mutations and additional molecular abnormalities would impact T-ALL outcome in a series of 138 T-ALL paediatric cases. METHODS: T-ALL subtypes, status of SIL-TAL1 fusion, ectopic expression of TLX3, and mutations in FBXW7, KRAS, PTEN and NOTCH1 were assessed as overall survival (OS) and event-free survival (EFS) prognostic factors. OS and EFS were determined using the Kaplan-Meier method and compared using the log-rank test. RESULTS: The frequencies of mutations were 43.5% for NOTCH1, while FBXW7, KRAS and PTEN exhibited frequencies of 19.1%, 9.5% and 9.4%, respectively. In 78.3% of cases, the coexistence of NOTCH1 mutations and other molecular alterations was observed. In multivariate analysis no statistical association was revealed between NOTCH1 mutations and any other variable analyzed. The mean length of the follow-up was 68.4 months and the OS was 50.7%. SIL-TAL1 was identified as an adverse prognostic factor. NOTCH1 mutation status was not associated with outcome, while the presence of NOTCH1 complex mutations (indels) were associated with a longer overall survival (p = 0.031) than point mutations. CONCLUSION: NOTCH1 mutations alone or in combination with FBXW7 did not impact T-ALL prognosis. Nevertheless, complex NOTCH1 mutations appear to have a positive impact on OS and the SIL-TAL1 fusion was validated as a negative prognostic marker in our series of T-ALL.
Assuntos
Leucemia de Células T/genética , Leucemia de Células T/mortalidade , Mutação , Receptor Notch1/genética , Adolescente , Proteínas de Ciclo Celular/genética , Criança , Pré-Escolar , Proteínas F-Box/genética , Proteína 7 com Repetições F-Box-WD , Feminino , Predisposição Genética para Doença , Proteínas de Homeodomínio/genética , Humanos , Lactente , Estimativa de Kaplan-Meier , Masculino , Proteínas de Fusão Oncogênica/genética , Modelos de Riscos Proporcionais , Proteínas Proto-Oncogênicas/genética , Proteínas Proto-Oncogênicas p21(ras) , Ubiquitina-Proteína Ligases/genética , Proteínas ras/genéticaRESUMO
T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) may affect children in very early age. However, the critical events leading to this brief latency is still unclear. We used standard methods to explore NOTCH1 mutations and other specific molecular markers in 15 early childhood T-ALL cases. Most of them consisted of immature differentiation subtype. Despite being found in a lower frequency than that described for overall pediatric T-ALL, NOTCH1 alterations were the most frequent ones. Other alterations included MLL(+) (n=4), SIL-TAL1(+) (n=3), FLT3 mutation (n=1) and HOX11L2(+) (n=1). Our results suggest that NOTCH1 and MLL abnormalities are primary leukemogenic hits in early T-ALL.
Assuntos
Mutação , Proteína de Leucina Linfoide-Mieloide/genética , Leucemia-Linfoma Linfoblástico de Células T Precursoras/genética , Receptor Notch1/genética , Transformação Celular Neoplásica/genética , Pré-Escolar , Aberrações Cromossômicas , Feminino , Rearranjo Gênico/fisiologia , Genes Codificadores da Cadeia delta de Receptores de Linfócitos T , Genes Codificadores da Cadeia gama de Receptores de Linfócitos T , Testes Genéticos , Histona-Lisina N-Metiltransferase , Humanos , Lactente , Masculino , Mutação/fisiologiaRESUMO
Denaturing high-performance liquid chromatography (dHPLC) was developed to screen DNA variations by separating heteroduplex and homoduplex DNA fragments by ion-pair reverse-phase liquid chromatography. In this study, we have evaluated the dHPLC screening method and direct sequencing for the detection of GATA1 mutations in peripheral blood and bone marrow aspirates samples from children with Down syndrome (DS). Cases were ascertained consecutively as part of an epidemiological study of DS and hematological disorders in Brazil. A total of 130 samples corresponding to 115 children with DS were analysed using dHPLC and direct sequencing methods to detect mutations in GATA1 exons 2, 3 and 4 gene sequences. The overall detection rate of sequencing and dHPLC screening methods was similar. Twenty mutations were detected in exon 2 and one mutation in exon 3 (c.231_232 dupGT) sequences of acute megakaryoblastic leukemia and transient leukemia samples. Four GATA1 mutations were newly described [c.155C > G; c.156_178 del23 bp; c.29_30 del GG; c.182C > A and c.151A > T,c.153_162 del 10 bp). Out of four, three had single nucleotide change. In conclusion, our results indicate that dHPLC is an efficient and valuable tool for GATA1 mutational analysis.
Assuntos
Cromatografia Líquida de Alta Pressão/métodos , Análise Mutacional de DNA/métodos , Síndrome de Down/genética , Fator de Transcrição GATA1/genética , Brasil/epidemiologia , Pré-Escolar , Cromatografia Líquida de Alta Pressão/normas , Síndrome de Down/complicações , Síndrome de Down/epidemiologia , Feminino , Doenças Hematológicas , Humanos , Lactente , Recém-Nascido , Leucemia/genética , Masculino , Mutação , Análise de Sequência de DNARESUMO
It has been reported that somatic mutations in the X-linked GATA1 gene are present in hematological clonal disorders in children with Down syndrome (DS). We analyzed retrospective samples of DS children with acute myeloid leukemia, transient leukemia (TL), and myelodysplastic syndrome (MDS) to test whether the specificity of GATA1 mutations can be helpful in distinguishing these hematopoietic disorders. A total of 49 samples were subjected to GATA1 mutation screening by direct sequencing and denaturing polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). Mutations in exon 2 of GATA1 were detected in six of eight DS-AML M7 samples and in four of six DS-TL; no mutation was detected in 13 children with acute lymphoblastic leukemia (DS-ALL), 6 with DS-AML (M0, M2, and M5), 6 with DS-MDS and in 8 DS infants without hematological disorders and 2 children with AML M7 without DS. Blast cells proportion in the sample represented a critical aspect on the sensitivity of mutation detection in GATA1, and a combination of sequence analysis and PAGE is necessary to detect mutations when blast percentage is low. The absence of detected mutations in any of the DS-MDS cases raises the question whether MDS in DS children is an intermediate stage between TL and AML M7, as previously suggested.
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Síndrome de Down/genética , Fator de Transcrição GATA1/genética , Leucemia Mieloide Aguda/genética , Mutação/genética , Estudos de Casos e Controles , Pré-Escolar , Análise Mutacional de DNA , Humanos , Lactente , Recém-NascidoRESUMO
As leucemias resultam de uma interação adversa entre gene-ambiente, com susceptibilidade condicionada, pelo menos em parte, por polimorfismos de múltiplos genes. Como a metilenotetrahidrofolato redutase (MTHFR) possui papel chave no metabolismo do folato, alterações na sua atividade (resultante de polimorfismos) ou alterações na suplementação de folato, podem influenciar na síntese, reparo e metilação de DNA. Neste estudo, determinamos a frequência dos polimorfismos 677C maior que T e 1298A maior que C do gene MTHFR em 177 crianças menores de 16 anos com leucemias agudas (LA) de diversas regiões brasileiras e em 249 amostras de indivíduos normais como o grupo controle. O método utilizado para genotipagem foi PCR-RFLP. As frequências dos genótipos 677CC, 677CT e 677TT foram 51 por cento, 40 por cento e 9 por cento nos controles, 57 por cento, 33 por cento e 10 por cento para os casos de leucemia linfoblástica aguda (LLA), e 49 por cento, 39 por cento e 12 por cento para os casos de leucemia mielóide aguda (LMA), respectivamente. Já as frequências dos genótipos 1298AA, 1298AC e 1298CC foram respectivamente 62 por cento, 31 por cento e 7 por cento nos controles, 51 por cento, 41 por cento e 8 por cento nos casos de LLA e, 67 por cento, 31 por cento e 2 por cento nos casos de LMA, respectivamente. Quando comparamos casos de LLA com os controles, para o polimorfismo 677C maoir que T, encontramos um OR igual a 0,7 (0,5 - 1,2) e OR igual a 1,0 (0,4 - 2,1) para os genótipos CT e TT, respectivamente. Para o polimorfismo 1298A maior que C, o OR foi 1,6 (1,0 - 2,5) e 1,3 (0,6-3,0) para os genótipos AC e CC, respectivamente. Para os casos de LMA, o OR foi 1,0 (0,5 - 2,1) para o genótipo CT, e 1,3 (0,5 - 3,9) para o genótipo TT. Para o genótipo AC, encontramos um OR igual a 0,9 (0,4 - 1,9); para o genótipo CC, o OR foi 0,3 (0,04 - 2,3). Não houve diferenças entre as frequências do MTHFR 677C maior que T e1298A maior que C em ambos os grupos na análise global. Os resultados indicam que MTHFR 677C maior que T e 1298A maior que C não conferem efeito protetor contra a LA infantil.
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Humanos , Masculino , Feminino , Lactente , Pré-Escolar , Criança , Adolescente , Leucemia Mieloide Aguda/genética , Leucemia-Linfoma Linfoblástico de Células Precursoras/genética , Polimorfismo Genético , GenótipoRESUMO
Treacher Collins syndrome (TCS) is an autosomal dominant craniofacial malformation caused by null mutations in the TCOF1 gene. High inter and intra familial clinical variability, ranging from mild malar hypoplasia to perinatal death due to airway collapse is observed, but, to date, no genotype-phenotype correlation has been reported. Considering haploinsufficiency as the molecular mechanism underlying the disease, we have hypothesized that mutations in the promoter region of the gene, which has never been previously characterized, in trans with a pathogenic mutation, could modulate the phenotype. Therefore, the aims of the present study were to determine the TCOF1 gene's core promoter and to identify mutations in this region that could contribute to the phenotypic variation observed in this syndrome. We have delimitated the minimal promoter to a region of less than 150 bp, with 63% of identity among 5 different species. We screened 1.2 kbp of the TCOF1 5' flanking sequence in the DNA obtained from 21 patients and 51 controls and identified four new single nucleotide polymorphisms (SNPs), one of which (-346C>T), was proved to be functional, as it decreased the promoter activity by 38%. Electrophoretic mobility shift assay (EMSA) analysis demonstrated that the -346T allele impairs DNA-binding to the YY1 transcription factor. This promoter variant represents a candidate allele to explain the clinical variability in patients bearing TCS.
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Proteínas Nucleares/genética , Fosfoproteínas/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Regiões Promotoras Genéticas/genética , Fator de Transcrição YY1/metabolismo , Alelos , Animais , Sequência de Bases , Ligação Competitiva , Brasil , Linhagem Celular Tumoral , Análise Mutacional de DNA , Cães , Ensaio de Desvio de Mobilidade Eletroforética , Saúde da Família , Feminino , Regulação da Expressão Gênica , Frequência do Gene , Testes Genéticos , Vetores Genéticos/genética , Humanos , Masculino , Disostose Mandibulofacial/diagnóstico , Disostose Mandibulofacial/genética , Camundongos , Dados de Sequência Molecular , Mutação , Proteínas Nucleares/metabolismo , Pan troglodytes , Linhagem , Fosfoproteínas/metabolismo , Ligação Proteica/genética , Ratos , Alinhamento de Sequência , Homologia de Sequência do Ácido Nucleico , Especificidade da Espécie , Transfecção , Fator de Transcrição YY1/genéticaRESUMO
Na comunicacão científica, precisamos respeitar os princípios de clareza, precisão, comunicabilidade e consistência. Para isso, existe um comitê de nomenclatura genética, cuja funcão é assegurar que cada gene humano tenha um nome e símbolo únicos que sejam usados consistentemente na literatura científica. Apesar dos esforcos, ainda encontramos textos onde o autor se refere a um gene usando um símbolo obsoleto, ou não faz a distincão adequada entre o gene e a proteína, prejudicando a compreensão por parte do leitor. Com isso em mente, apresento uma revisão das regras de nomenclatura de genes e diversos recursos disponíveis através da Internet para encontrar os nomes adequados dos genes, enfatizando aqueles envolvidos em câncer.
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Genética/classificação , TerminologiaRESUMO
Transient myeloproliferative disorder is a form of self-limited leukemia that occurs almost exclusively in neonates with Down syndrome. The authors report an unusual case of a newborn without constitutional trisomy 21 who developed undifferentiated leukemia and subsequently achieved clinical and molecular remission without chemotherapy. Cytogenetics and molecular analysis have shown trisomy 21 and GATA1 mutation restricted to leukemic cells. G-to-T transversion was detected, which is predicted to result in a premature stop codon (c.119G>T; pGlu67X) in diagnosis samples. These findings emphasize that there must be a powerful interaction between GATA1 and trisomy 21 in leukemogenesis process.
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Proteínas de Ligação a DNA/genética , Síndrome de Down/genética , Transtornos Mieloproliferativos/genética , Fatores de Transcrição/genética , Sequência de Bases , Fatores de Ligação de DNA Eritroide Específicos , Feminino , Fator de Transcrição GATA1 , Humanos , Recém-Nascido , Leucócitos/fisiologia , Mutação , Regressão Neoplásica EspontâneaRESUMO
A sindrome de Treacher Collins (STC) e um disturbio do desenvolvimento craniofacial de heranca autossomica dominante que afeta 1 em 50.000 recem-nascidos, sendo que aproximadamente 60 por cento dos casos sao resultantes de mutacoes novas...