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Elife ; 92020 05 14.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32406817

RESUMO

The transcriptional activation and repression during NK cell ontology are poorly understood. Here, using single-cell RNA-sequencing, we reveal a novel role for T-bet in suppressing the immature gene signature during murine NK cell development. Based on transcriptome, we identified five distinct NK cell clusters and define their relative developmental maturity in the bone marrow. Transcriptome-based machine-learning classifiers revealed that half of the mTORC2-deficient NK cells belongs to the least mature NK cluster. Mechanistically, loss of mTORC2 results in an increased expression of signature genes representing immature NK cells. Since mTORC2 regulates the expression of T-bet through AktS473-FoxO1 axis, we further characterized the T-bet-deficient NK cells and found an augmented immature transcriptomic signature. Moreover, deletion of Foxo1 restores the expression of T-bet and corrects the abnormal expression of immature NK genes. Collectively, our study reveals a novel role for mTORC2-AktS473-FoxO1-T-bet axis in suppressing the transcriptional signature of immature NK cells.


Assuntos
Células da Medula Óssea/metabolismo , Perfilação da Expressão Gênica , Células Matadoras Naturais/metabolismo , Aprendizado de Máquina , RNA-Seq , Análise de Célula Única , Proteínas com Domínio T/genética , Transcriptoma , Animais , Células da Medula Óssea/imunologia , Análise por Conglomerados , Proteína Forkhead Box O1/genética , Proteína Forkhead Box O1/metabolismo , Regulação da Expressão Gênica , Genótipo , Células Matadoras Naturais/imunologia , Alvo Mecanístico do Complexo 2 de Rapamicina/deficiência , Alvo Mecanístico do Complexo 2 de Rapamicina/genética , Camundongos Endogâmicos C57BL , Camundongos Knockout , Fenótipo , Proteínas Proto-Oncogênicas c-akt/genética , Proteínas Proto-Oncogênicas c-akt/metabolismo , Proteína Companheira de mTOR Insensível à Rapamicina/deficiência , Proteína Companheira de mTOR Insensível à Rapamicina/genética , Proteína Regulatória Associada a mTOR/deficiência , Proteína Regulatória Associada a mTOR/genética , Proteínas com Domínio T/metabolismo
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