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1.
Nucleic Acids Res ; 31(18): 5440-8, 2003 Sep 15.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-12954781

RESUMO

DNA methyltransferases (MTases) are sequence-specific enzymes which transfer a methyl group from S-adenosyl-L-methionine (AdoMet) to the amino group of either cytosine or adenine within a recognized DNA sequence. Methylation of a base in a specific DNA sequence protects DNA from nucleolytic cleavage by restriction enzymes recognizing the same DNA sequence. We have determined at 1.74 A resolution the crystal structure of a beta-class DNA MTase MboIIA (M.MboIIA) from the bacterium Moraxella bovis, the smallest DNA MTase determined to date. M.MboIIA methylates the 3' adenine of the pentanucleotide sequence 5'-GAAGA-3'. The protein crystallizes with two molecules in the asymmetric unit which we propose to resemble the dimer when M.MboIIA is not bound to DNA. The overall structure of the enzyme closely resembles that of M.RsrI. However, the cofactor-binding pocket in M.MboIIA forms a closed structure which is in contrast to the open-form structures of other known MTases.


Assuntos
Moraxella bovis/enzimologia , DNA Metiltransferases Sítio Específica (Adenina-Específica)/química , Sequência de Aminoácidos , Proteínas de Bactérias/química , Proteínas de Bactérias/genética , Proteínas de Bactérias/metabolismo , Sítios de Ligação , Cristalografia por Raios X , DNA/genética , DNA/metabolismo , Dimerização , Ligação de Hidrogênio , Modelos Moleculares , Dados de Sequência Molecular , Moraxella bovis/genética , Ligação Proteica , Estrutura Secundária de Proteína , Homologia de Sequência de Aminoácidos , DNA Metiltransferases Sítio Específica (Adenina-Específica)/genética , DNA Metiltransferases Sítio Específica (Adenina-Específica)/metabolismo
2.
FEMS Microbiol Lett ; 225(2): 279-84, 2003 Aug 29.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-12951253

RESUMO

Moraxella bovis expresses an iron-repressible 79-kDa outer-membrane protein, IrpA. DNA and N-terminal amino acid sequence analysis indicate that IrpA is closely related to FrpB of Neisseria meningitidis, FetA of Neisseria gonorrhoeae and CopB of Moraxella catarrhalis. The results of manganese mutagenesis and a gel-shift assay suggested that the transcription of irpA is negatively regulated by the ferric uptake regulator. The insertion of an antibiotic resistance cassette into the irpA gene affected the strain's ability to utilize bovine transferrin and lactoferrin. IrpA was detected in geographically diverse clinical isolates, and the antigenicity of IrpA was conserved in all the isolates tested. Therefore, IrpA may have potential as a candidate vaccine.


Assuntos
Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/genética , Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/metabolismo , Ferro/metabolismo , Moraxella bovis/genética , Moraxella bovis/metabolismo , Sequência de Aminoácidos , Proteínas da Membrana Bacteriana Externa/química , Proteínas de Bactérias/genética , Proteínas de Bactérias/metabolismo , Western Blotting , Clonagem Molecular , Eletroforese em Gel de Poliacrilamida , Ensaio de Desvio de Mobilidade Eletroforética , Regulação Bacteriana da Expressão Gênica , Lactoferrina/metabolismo , Dados de Sequência Molecular , Peso Molecular , Mutagênese , Reação em Cadeia da Polimerase , Proteínas Repressoras/genética , Proteínas Repressoras/metabolismo , Análise de Sequência de DNA , Análise de Sequência de Proteína , Homologia de Sequência , Transferrina/metabolismo
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