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Current status of protein force fields for molecular dynamics simulations.
Lopes, Pedro E M; Guvench, Olgun; MacKerell, Alexander D.
Afiliação
  • Lopes PE; Department of Pharmaceutical Sciences, School of Pharmacy, University of Maryland, 20 Penn Street HSFII, Baltimore, MD, 21201, USA.
Methods Mol Biol ; 1215: 47-71, 2015.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25330958
ABSTRACT
The current status of classical force fields for proteins is reviewed. These include additive force fields as well as the latest developments in the Drude and AMOEBA polarizable force fields. Parametrization strategies developed specifically for the Drude force field are described and compared with the additive CHARMM36 force field. Results from molecular simulations of proteins and small peptides are summarized to illustrate the performance of the Drude and AMOEBA force fields.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Temas: Geral Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas / Simulação de Dinâmica Molecular Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Temas: Geral Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Proteínas / Simulação de Dinâmica Molecular Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos