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J Virol Methods ; 241: 58-63, 2017 03.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27993615

RESUMO

Equine herpesvirus myeloencephalopathy (EHM), a major problem for the equine industry in the United States, is caused by equine herpesvirus-1 (EHV-1). In addition, EHV-1 is associated with upper respiratory disease, abortion, and chorioretinal lesions in horses. Here we describe the development and evaluation of an inexpensive, user-friendly insulated isothermal PCR (iiPCR) method targeting open reading 30 (ORF30) to detect both neuropathogenic and non-neuropathogenic strains on the field-deployable POCKIT™ device for point-of-need detection of EHV-1. The analytical sensitivity of the EHV-1 iiPCR assay was 13 genome equivalents per reaction. The assay did not cross react with ten non-target equine viral pathogens. Performance of the EHV-1 iiPCR assay was compared to two previously described real-time PCR (qPCR) assays in two laboratories by using 104 archived clinical samples. All 53 qPCR-positive and 46 of the 51 qPCR-negative samples tested positive and negative, respectively, by the iiPCR. The agreement between the two assays was 95.19% (confidence interval 90.48-99.90%) with a kappa value of 0.90. In conclusion, the newly developed EHV-1 iiPCR assay is robust to provide specificity and sensitivity comparable to qPCR assays for the detection of EHV-1 nucleic acid in clinical specimens.


Assuntos
Infecções por Herpesviridae/veterinária , Herpesvirus Equídeo 1/isolamento & purificação , Doenças dos Cavalos/diagnóstico , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/métodos , Animais , DNA Viral/genética , DNA Viral/isolamento & purificação , Encefalomielite/diagnóstico , Encefalomielite/veterinária , Encefalomielite/virologia , Infecções por Herpesviridae/diagnóstico , Infecções por Herpesviridae/virologia , Herpesvirus Equídeo 1/genética , Doenças dos Cavalos/virologia , Cavalos , Fases de Leitura Aberta/genética , Reação em Cadeia da Polimerase/economia , Sensibilidade e Especificidade , Temperatura
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