Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS Enfermería

1.

Identifying Epistasis in Cancer Genomes: A Delicate Affair.

van de Haar, Joris; Canisius, Sander; Yu, Michael K; Voest, Emile E; Wessels, Lodewyk F A; Ideker, Trey.

Cell ; 177(6): 1375-1383, 2019 05 30.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31150618

2.

A Multiscale Map of the Stem Cell State in Pancreatic Adenocarcinoma.

Lytle, Nikki K; Ferguson, L Paige; Rajbhandari, Nirakar; Gilroy, Kathryn; Fox, Raymond G; Deshpande, Anagha; Schürch, Christian M; Hamilton, Michael; Robertson, Neil; Lin, Wei; Noel, Pawan; Wartenberg, Martin; Zlobec, Inti; Eichmann, Micha; Galván, José A; Karamitopoulou, Eva; Gilderman, Tami; Esparza, Lourdes Adriana; Shima, Yutaka; Spahn, Philipp; French, Randall; Lewis, Nathan E; Fisch, Kathleen M; Sasik, Roman; Rosenthal, Sara Brin; Kritzik, Marcie; Von Hoff, Daniel; Han, Haiyong; Ideker, Trey; Deshpande, Aniruddha J; Lowy, Andrew M; Adams, Peter D; Reya, Tannishtha.

Cell ; 177(3): 572-586.e22, 2019 04 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30955884

3.

Visible Machine Learning for Biomedicine.

Yu, Michael K; Ma, Jianzhu; Fisher, Jasmin; Kreisberg, Jason F; Raphael, Benjamin J; Ideker, Trey.

Cell ; 173(7): 1562-1565, 2018 06 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29906441

4.

The Psychiatric Cell Map Initiative: A Convergent Systems Biological Approach to Illuminating Key Molecular Pathways in Neuropsychiatric Disorders.

Willsey, A Jeremy; Morris, Montana T; Wang, Sheng; Willsey, Helen R; Sun, Nawei; Teerikorpi, Nia; Baum, Tierney B; Cagney, Gerard; Bender, Kevin J; Desai, Tejal A; Srivastava, Deepak; Davis, Graeme W; Doudna, Jennifer; Chang, Edward; Sohal, Vikaas; Lowenstein, Daniel H; Li, Hao; Agard, David; Keiser, Michael J; Shoichet, Brian; von Zastrow, Mark; Mucke, Lennart; Finkbeiner, Steven; Gan, Li; Sestan, Nenad; Ward, Michael E; Huttenhain, Ruth; Nowakowski, Tomasz J; Bellen, Hugo J; Frank, Loren M; Khokha, Mustafa K; Lifton, Richard P; Kampmann, Martin; Ideker, Trey; State, Matthew W; Krogan, Nevan J.

Cell ; 174(3): 505-520, 2018 07 26.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30053424

5.

MHC-I Genotype Restricts the Oncogenic Mutational Landscape.

Marty, Rachel; Kaabinejadian, Saghar; Rossell, David; Slifker, Michael J; van de Haar, Joris; Engin, Hatice Billur; de Prisco, Nicola; Ideker, Trey; Hildebrand, William H; Font-Burgada, Joan; Carter, Hannah.

Cell ; 171(6): 1272-1283.e15, 2017 Nov 30.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29107334

6.

Siri of the cell: what biology could learn from the iPhone.

Carvunis, Anne-Ruxandra; Ideker, Trey.

Cell ; 157(3): 534-8, 2014 Apr 24.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24766803

7.

Functional landscape of SARS-CoV-2 cellular restriction.

Martin-Sancho, Laura; Lewinski, Mary K; Pache, Lars; Stoneham, Charlotte A; Yin, Xin; Becker, Mark E; Pratt, Dexter; Churas, Christopher; Rosenthal, Sara B; Liu, Sophie; Weston, Stuart; De Jesus, Paul D; O'Neill, Alan M; Gounder, Anshu P; Nguyen, Courtney; Pu, Yuan; Curry, Heather M; Oom, Aaron L; Miorin, Lisa; Rodriguez-Frandsen, Ariel; Zheng, Fan; Wu, Chunxiang; Xiong, Yong; Urbanowski, Matthew; Shaw, Megan L; Chang, Max W; Benner, Christopher; Hope, Thomas J; Frieman, Matthew B; García-Sastre, Adolfo; Ideker, Trey; Hultquist, Judd F; Guatelli, John; Chanda, Sumit K.

Mol Cell ; 81(12): 2656-2668.e8, 2021 06 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33930332

8.

Modeling transcriptome dynamics in a complex world.

Jaeger, Philipp A; Doherty, Colleen; Ideker, Trey.

Cell ; 151(6): 1161-2, 2012 Dec 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23217702

9.

PKCÎµ promotes oncogenic functions of ATF2 in the nucleus while blocking its apoptotic function at mitochondria.

Lau, Eric; Kluger, Harriet; Varsano, Tal; Lee, KiYoung; Scheffler, Immo; Rimm, David L; Ideker, Trey; Ronai, Ze'ev A.

Cell ; 148(3): 543-55, 2012 Feb 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22304920

10.

A multi-scale map of cell structure fusing protein images and interactions.

Qin, Yue; Huttlin, Edward L; Winsnes, Casper F; Gosztyla, Maya L; Wacheul, Ludivine; Kelly, Marcus R; Blue, Steven M; Zheng, Fan; Chen, Michael; Schaffer, Leah V; Licon, Katherine; Bäckström, Anna; Vaites, Laura Pontano; Lee, John J; Ouyang, Wei; Liu, Sophie N; Zhang, Tian; Silva, Erica; Park, Jisoo; Pitea, Adriana; Kreisberg, Jason F; Gygi, Steven P; Ma, Jianzhu; Harper, J Wade; Yeo, Gene W; Lafontaine, Denis L J; Lundberg, Emma; Ideker, Trey.

Nature ; 600(7889): 536-542, 2021 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34819669

11.

Boosting signal-to-noise in complex biology: prior knowledge is power.

Ideker, Trey; Dutkowski, Janusz; Hood, Leroy.

Cell ; 144(6): 860-3, 2011 Mar 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21414478

12.

DNA Methylation Clocks in Aging: Categories, Causes, and Consequences.

Field, Adam E; Robertson, Neil A; Wang, Tina; Havas, Aaron; Ideker, Trey; Adams, Peter D.

Mol Cell ; 71(6): 882-895, 2018 09 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30241605

13.

Systematic Gene-to-Phenotype Arrays: A High-Throughput Technique for Molecular Phenotyping.

Jaeger, Philipp A; Ornelas, Lilia; McElfresh, Cameron; Wong, Lily R; Hampton, Randolph Y; Ideker, Trey.

Mol Cell ; 69(2): 321-333.e3, 2018 01 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29351850

14.

The Dfm1 Derlin Is Required for ERAD Retrotranslocation of Integral Membrane Proteins.

Neal, Sonya; Jaeger, Philipp A; Duttke, Sascha H; Benner, Christopher; K Glass, Christopher; Ideker, Trey; Hampton, Randolph Y.

Mol Cell ; 69(2): 306-320.e4, 2018 01 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29351849

15.

Combinatorial CRISPR-Cas9 Metabolic Screens Reveal Critical Redox Control Points Dependent on the KEAP1-NRF2 Regulatory Axis.

Zhao, Dongxin; Badur, Mehmet G; Luebeck, Jens; Magaña, Jose H; Birmingham, Amanda; Sasik, Roman; Ahn, Christopher S; Ideker, Trey; Metallo, Christian M; Mali, Prashant.

Mol Cell ; 69(4): 699-708.e7, 2018 02 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29452643

16.

Representing mutations for predicting cancer drug response.

Wall, Patrick; Ideker, Trey.

Bioinformatics ; 40(Supplement_1): i160-i168, 2024 Jun 28.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38940147

17.

An atlas of combinatorial transcriptional regulation in mouse and man.

Ravasi, Timothy; Suzuki, Harukazu; Cannistraci, Carlo Vittorio; Katayama, Shintaro; Bajic, Vladimir B; Tan, Kai; Akalin, Altuna; Schmeier, Sebastian; Kanamori-Katayama, Mutsumi; Bertin, Nicolas; Carninci, Piero; Daub, Carsten O; Forrest, Alistair R R; Gough, Julian; Grimmond, Sean; Han, Jung-Hoon; Hashimoto, Takehiro; Hide, Winston; Hofmann, Oliver; Kamburov, Atanas; Kaur, Mandeep; Kawaji, Hideya; Kubosaki, Atsutaka; Lassmann, Timo; van Nimwegen, Erik; MacPherson, Cameron Ross; Ogawa, Chihiro; Radovanovic, Aleksandar; Schwartz, Ariel; Teasdale, Rohan D; Tegnér, Jesper; Lenhard, Boris; Teichmann, Sarah A; Arakawa, Takahiro; Ninomiya, Noriko; Murakami, Kayoko; Tagami, Michihira; Fukuda, Shiro; Imamura, Kengo; Kai, Chikatoshi; Ishihara, Ryoko; Kitazume, Yayoi; Kawai, Jun; Hume, David A; Ideker, Trey; Hayashizaki, Yoshihide.

Cell ; 140(5): 744-52, 2010 Mar 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20211142

18.

Active Interaction Mapping Reveals the Hierarchical Organization of Autophagy.

Kramer, Michael H; Farré, Jean-Claude; Mitra, Koyel; Yu, Michael Ku; Ono, Keiichiro; Demchak, Barry; Licon, Katherine; Flagg, Mitchell; Balakrishnan, Rama; Cherry, J Michael; Subramani, Suresh; Ideker, Trey.

Mol Cell ; 65(4): 761-774.e5, 2017 Feb 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28132844

19.

NDEx IQuery: a multi-method network gene set analysis leveraging the Network Data Exchange.

Pillich, Rudolf T; Chen, Jing; Churas, Christopher; Fong, Dylan; Gyori, Benjamin M; Ideker, Trey; Karis, Klas; Liu, Sophie N; Ono, Keiichiro; Pico, Alexander; Pratt, Dexter.

Bioinformatics ; 39(3)2023 03 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36882166

20.

A decade of systems biology.

Chuang, Han-Yu; Hofree, Matan; Ideker, Trey.

Annu Rev Cell Dev Biol ; 26: 721-44, 2010.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20604711

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