Detalles de la búsqueda
1.
Epidemiological data analysis of viral quasispecies in the next-generation sequencing era.
Brief Bioinform
; 22(1): 96-108, 2021 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32568371
2.
Accurate assembly of minority viral haplotypes from next-generation sequencing through efficient noise reduction.
Nucleic Acids Res
; 49(17): e102, 2021 09 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34214168
3.
MicrobeTrace: Retooling molecular epidemiology for rapid public health response.
PLoS Comput Biol
; 17(9): e1009300, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34492010
4.
Using earth mover's distance for viral outbreak investigations.
BMC Genomics
; 21(Suppl 5): 582, 2020 Dec 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33327932
5.
Unlocking capacities of genomics for the COVID-19 response and future pandemics.
Nat Methods
; 19(4): 374-380, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35396471
6.
Repeat-aware evaluation of scaffolding tools.
Bioinformatics
; 34(15): 2530-2537, 2018 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29547882
7.
QUENTIN: reconstruction of disease transmissions from viral quasispecies genomic data.
Bioinformatics
; 34(1): 163-170, 2018 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29304222
8.
Inference of genetic relatedness between viral quasispecies from sequencing data.
BMC Genomics
; 18(Suppl 10): 918, 2017 Dec 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29244009
9.
Modeling conformational redox-switch modulation of human succinic semialdehyde dehydrogenase.
Proteins
; 83(12): 2217-29, 2015 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26422261
10.
Electronic health record signatures identify undiagnosed patients with common variable immunodeficiency disease.
Sci Transl Med
; 16(745): eade4510, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38691621
11.
High HIV diversity, recombination, and superinfection revealed in a large outbreak among persons who inject drugs in Kentucky and Ohio, USA.
Virus Evol
; 10(1): veae015, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38510920
12.
The UCLA ATLAS Community Health Initiative: Promoting precision health research in a diverse biobank.
Cell Genom
; 3(1): 100243, 2023 Jan 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36777178
13.
Meta-analysis of (single-cell method) benchmarks reveals the need for extensibility and interoperability.
Genome Biol
; 24(1): 119, 2023 05 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37198712
14.
Creation and Use of Highly Adaptive Productive and Technological Red Currant Genotypes to Improve the Assortment and Introduction into Different Ecological and Geographical Zones.
Plants (Basel)
; 11(6)2022 Mar 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35336684
15.
Leveraging genomic diversity for discovery in an electronic health record linked biobank: the UCLA ATLAS Community Health Initiative.
Genome Med
; 14(1): 104, 2022 Sep 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36085083
16.
Scalable Reconstruction of SARS-CoV-2 Phylogeny with Recurrent Mutations.
J Comput Biol
; 28(11): 1130-1141, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34698524
17.
Pipeline for Analyzing Activity of Metabolic Pathways in Planktonic Communities Using Metatranscriptomic Data.
J Comput Biol
; 28(8): 842-855, 2021 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34264744
18.
From Alpha to Zeta: Identifying Variants and Subtypes of SARS-CoV-2 Via Clustering.
J Comput Biol
; 28(11): 1113-1129, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34698508
19.
Molecular Epidemiological Analysis of the Origin and Transmission Dynamics of the HIV-1 CRF01_AE Sub-Epidemic in Bulgaria.
Viruses
; 13(1)2021 Jan 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33467166
20.
Technology dictates algorithms: recent developments in read alignment.
Genome Biol
; 22(1): 249, 2021 08 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34446078