Detalhe da pesquisa
1.
ESICCC as a systematic computational framework for evaluation, selection, and integration of cell-cell communication inference methods.
Genome Res
; 33(10): 1788-1805, 2023 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37827697
2.
scEVOLVE: cell-type incremental annotation without forgetting for single-cell RNA-seq data.
Brief Bioinform
; 25(2)2024 Jan 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38366803
3.
scBOL: a universal cell type identification framework for single-cell and spatial transcriptomics data.
Brief Bioinform
; 25(3)2024 Mar 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38678389
4.
Continually adapting pre-trained language model to universal annotation of single-cell RNA-seq data.
Brief Bioinform
; 25(2)2024 Jan 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38388681
5.
SPANN: annotating single-cell resolution spatial transcriptome data with scRNA-seq data.
Brief Bioinform
; 25(2)2024 Jan 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38279647
6.
scGAD: a new task and end-to-end framework for generalized cell type annotation and discovery.
Brief Bioinform
; 24(2)2023 03 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36869836
7.
Rare variant association tests for ancestry-matched case-control data based on conditional logistic regression.
Brief Bioinform
; 23(2)2022 03 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35021184
8.
Clustering single-cell multi-omics data with MoClust.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36383167
9.
Hierarchical graph transformer with contrastive learning for protein function prediction.
Bioinformatics
; 39(7)2023 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37369035
10.
Ultrahighly Sensitive and Selective Glutathione Sensor Based on Carbon Dot-Functionalized Solution-Gate Graphene Transistor.
Anal Chem
; 95(48): 17750-17758, 2023 12 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37971943
11.
scNAME: neighborhood contrastive clustering with ancillary mask estimation for scRNA-seq data.
Bioinformatics
; 38(6): 1575-1583, 2022 03 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34999761
12.
scMRA: a robust deep learning method to annotate scRNA-seq data with multiple reference datasets.
Bioinformatics
; 38(3): 738-745, 2022 01 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34623390
13.
Profiling transcription factor activity dynamics using intronic reads in time-series transcriptome data.
PLoS Comput Biol
; 18(1): e1009762, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35007289
14.
Integrative Metabolome and Transcriptome Analyses Provide Insights into Carotenoid Variation in Different-Colored Peppers.
Int J Mol Sci
; 24(23)2023 Nov 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38068885
15.
Ultrasensitive Label-Free DNA Detection Based on Solution-Gated Graphene Transistors Functionalized with Carbon Quantum Dots.
Anal Chem
; 94(7): 3320-3327, 2022 02 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35147418
16.
Single-cell RNA-seq data semi-supervised clustering and annotation via structural regularized domain adaptation.
Bioinformatics
; 37(6): 775-784, 2021 05 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33098418
17.
Uncovering the Dominant Motion Modes of Allosteric Regulation Improves Allosteric Site Prediction.
J Chem Inf Model
; 62(1): 187-195, 2022 01 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34964625
18.
Mapping and functional characterization of the tomato spotted wilt virus resistance gene SlCHS3 in Solanum lycopersicum.
Mol Breed
; 42(9): 55, 2022 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37313421
19.
Aptamer-Based Solution-Gated Graphene Transistors for Highly Sensitive and Real-Time Detection of Thrombin Molecules.
Anal Chem
; 93(40): 13673-13679, 2021 10 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34597019
20.
scRMD: imputation for single cell RNA-seq data via robust matrix decomposition.
Bioinformatics
; 36(10): 3156-3161, 2020 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32119079