Detalhe da pesquisa
1.
KaMRaT: a C++ toolkit for k-mer count matrix dimension reduction.
Bioinformatics
; 40(3)2024 Mar 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38444086
2.
A Phylogenetic Framework to Simulate Synthetic Interspecies RNA-Seq Data.
Mol Biol Evol
; 40(1)2023 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36508357
3.
Reference-free transcriptome signatures for prostate cancer prognosis.
BMC Cancer
; 21(1): 394, 2021 Apr 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33845808
4.
A model selection criterion for model-based clustering of annotated gene expression data.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 14(5): 413-28, 2015 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26461845
5.
Data-based filtering for replicated high-throughput transcriptome sequencing experiments.
Bioinformatics
; 29(17): 2146-52, 2013 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23821648
6.
3D models of fungal chromosomes to enhance visual integration of omics data.
NAR Genom Bioinform
; 5(4): lqad104, 2023 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38058589
7.
Additional insights into the organization of transcriptional regulatory modules based on a 3D model of the Saccharomyces cerevisiae genome.
BMC Res Notes
; 15(1): 67, 2022 Feb 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35183229
8.
APPINetwork: an R package for building and computational analysis of protein-protein interaction networks.
PeerJ
; 10: e14204, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36353604
9.
The contribution of uncharted RNA sequences to tumor identity in lung adenocarcinoma.
NAR Cancer
; 4(1): zcac001, 2022 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35118386
10.
The X-ray fluorescence screening of multiple elements in herbarium specimens from the Neotropical region reveals new records of metal accumulation in plants.
Metallomics
; 13(8)2021 08 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34320190
11.
Reference-free transcriptome exploration reveals novel RNAs for prostate cancer diagnosis.
Life Sci Alliance
; 2(6)2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31732695
12.
DE-kupl: exhaustive capture of biological variation in RNA-seq data through k-mer decomposition.
Genome Biol
; 18(1): 243, 2017 12 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29284518
13.
A hierarchical poisson log-normal model for network inference from RNA sequencing data.
PLoS One
; 8(10): e77503, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24147011