Detalhe da pesquisa
1.
Proteogenomic Characterization of Endometrial Carcinoma.
Cell
; 180(4): 729-748.e26, 2020 02 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32059776
2.
Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma.
Cell
; 179(4): 964-983.e31, 2019 10 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31675502
3.
Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma.
Cell
; 180(1): 207, 2020 Jan 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31923397
4.
Sulfoproteomics Workflow with Precursor Ion Accurate Mass Shift Analysis Reveals Novel Tyrosine Sulfoproteins in the Golgi.
J Proteome Res
; 23(1): 71-83, 2024 01 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38112105
5.
PTM-Shepherd: Analysis and Summarization of Post-Translational and Chemical Modifications From Open Search Results.
Mol Cell Proteomics
; 20: 100018, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33568339
6.
Crystal-C: A Computational Tool for Refinement of Open Search Results.
J Proteome Res
; 19(6): 2511-2515, 2020 06 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32338005
7.
MSFragger: ultrafast and comprehensive peptide identification in mass spectrometry-based proteomics.
Nat Methods
; 14(5): 513-520, 2017 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28394336
8.
DeltaMass: Automated Detection and Visualization of Mass Shifts in Proteomic Open-Search Results.
J Proteome Res
; 18(2): 715-720, 2019 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30523686
9.
Philosopher: a versatile toolkit for shotgun proteomics data analysis.
Nat Methods
; 17(9): 869-870, 2020 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32669682
10.
Analysis of DIA proteomics data using MSFragger-DIA and FragPipe computational platform.
Nat Commun
; 14(1): 4154, 2023 07 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37438352
11.
Identification of modified peptides using localization-aware open search.
Nat Commun
; 11(1): 4065, 2020 08 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32792501
12.
Pervasive and dynamic protein binding sites of the mRNA transcriptome in Saccharomyces cerevisiae.
Genome Biol
; 14(2): R13, 2013 Feb 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23409723