Detalhe da pesquisa
1.
Critical review of conformational B-cell epitope prediction methods.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36611255
2.
Quantification of biases in predictions of protein-protein binding affinity changes upon mutations.
Brief Bioinform
; 25(1)2023 11 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38197311
3.
pycofitness-Evaluating the fitness landscape of RNA and protein sequences.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38335928
4.
FiTMuSiC: leveraging structural and (co)evolutionary data for protein fitness prediction.
Hum Genomics
; 18(1): 36, 2024 Apr 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38627807
5.
Prediction of Paratope-Epitope Pairs Using Convolutional Neural Networks.
Int J Mol Sci
; 25(10)2024 May 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38791470
6.
SpikePro: a webserver to predict the fitness of SARS-CoV-2 variants.
Bioinformatics
; 38(18): 4418-4419, 2022 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35861514
7.
Estimating the Vertical Ionization Potential of Single-Stranded DNA Molecules.
J Chem Inf Model
; 63(6): 1766-1775, 2023 03 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36877828
8.
NPTX1 mutations trigger endoplasmic reticulum stress and cause autosomal dominant cerebellar ataxia.
Brain
; 145(4): 1519-1534, 2022 05 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34788392
9.
CoCoNet-boosting RNA contact prediction by convolutional neural networks.
Nucleic Acids Res
; 49(22): 12661-12672, 2021 12 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34871451
10.
Perturbing dimer interactions and allosteric communication modulates the immunosuppressive activity of human galectin-7.
J Biol Chem
; 297(5): 101308, 2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34673030
11.
Evaluating DCA-based method performances for RNA contact prediction by a well-curated data set.
RNA
; 26(7): 794-802, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32276988
12.
MutaFrame-an interpretative visualization framework for deleteriousness prediction of missense variants in the human exome.
Bioinformatics
; 38(1): 265-266, 2021 12 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34165491
13.
SWOTein: a structure-based approach to predict stability Strengths and Weaknesses of prOTEINs.
Bioinformatics
; 37(14): 19631971, 2021 07 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33471089
14.
Analysis of the Neutralizing Activity of Antibodies Targeting Open or Closed SARS-CoV-2 Spike Protein Conformations.
Int J Mol Sci
; 23(4)2022 Feb 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35216194
15.
SOLart: a structure-based method to predict protein solubility and aggregation.
Bioinformatics
; 36(5): 1445-1452, 2020 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31603466
16.
pydca v1.0: a comprehensive software for direct coupling analysis of RNA and protein sequences.
Bioinformatics
; 36(7): 2264-2265, 2020 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31778142
17.
Large-scale in silico mutagenesis experiments reveal optimization of genetic code and codon usage for protein mutational robustness.
BMC Biol
; 18(1): 146, 2020 10 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33081759
18.
In Silico Analysis of the Molecular-Level Impact of SMPD1 Variants on Niemann-Pick Disease Severity.
Int J Mol Sci
; 22(9)2021 Apr 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33925997
19.
Shedding light on the dark matter of the biomolecular structural universe: Progress in RNA 3D structure prediction.
Methods
; 162-163: 68-73, 2019 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31028927
20.
Relation between DNA ionization potentials, single base substitutions and pathogenic variants.
BMC Genomics
; 20(Suppl 8): 551, 2019 Jul 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31307386