Detalles de la búsqueda
1.
Updated MS²PIP web server supports cutting-edge proteomics applications.
Nucleic Acids Res
; 51(W1): W338-W342, 2023 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37140039
2.
MS2Rescore 3.0 Is a Modular, Flexible, and User-Friendly Platform to Boost Peptide Identifications, as Showcased with MS Amanda 3.0.
J Proteome Res
; 2024 Mar 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38491990
3.
Benefit of In Silico Predicted Spectral Libraries in Data-Independent Acquisition Data Analysis Workflows.
J Proteome Res
; 2024 Apr 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38666436
4.
DeepLC can predict retention times for peptides that carry as-yet unseen modifications.
Nat Methods
; 18(11): 1363-1369, 2021 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34711972
5.
Universal Spectrum Identifier for mass spectra.
Nat Methods
; 18(7): 768-770, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34183830
6.
MS2Rescore: Data-Driven Rescoring Dramatically Boosts Immunopeptide Identification Rates.
Mol Cell Proteomics
; 21(8): 100266, 2022 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35803561
7.
Quality Control for the Target Decoy Approach for Peptide Identification.
J Proteome Res
; 22(2): 350-358, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36648107
8.
psm_utils: A High-Level Python API for Parsing and Handling Peptide-Spectrum Matches and Proteomics Search Results.
J Proteome Res
; 22(2): 557-560, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36508242
9.
ProteomicsML: An Online Platform for Community-Curated Data sets and Tutorials for Machine Learning in Proteomics.
J Proteome Res
; 22(2): 632-636, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36693629
10.
Proteomics Standards Initiative at Twenty Years: Current Activities and Future Work.
J Proteome Res
; 22(2): 287-301, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36626722
11.
The nutritional composition and cell size of microbial biomass for food applications are defined by the growth conditions.
Microb Cell Fact
; 22(1): 254, 2023 Dec 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38072930
12.
Spectral Prediction Features as a Solution for the Search Space Size Problem in Proteogenomics.
Mol Cell Proteomics
; 20: 100076, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33823297
13.
Sensitive and Specific Spectral Library Searching with CompOmics Spectral Library Searching Tool and Percolator.
J Proteome Res
; 21(5): 1365-1370, 2022 05 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35446579
14.
A Comprehensive Evaluation of Consensus Spectrum Generation Methods in Proteomics.
J Proteome Res
; 21(6): 1566-1574, 2022 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35549218
15.
Proteomics Standards Initiative's ProForma 2.0: Unifying the Encoding of Proteoforms and Peptidoforms.
J Proteome Res
; 21(4): 1189-1195, 2022 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35290070
16.
Cov2MS: An Automated and Quantitative Matrix-Independent Assay for Mass Spectrometric Measurement of SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein.
Anal Chem
; 94(50): 17379-17387, 2022 12 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36490367
17.
Personalized Proteome: Comparing Proteogenomics and Open Variant Search Approaches for Single Amino Acid Variant Detection.
J Proteome Res
; 20(6): 3353-3364, 2021 06 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33998808
18.
Updated MS²PIP web server delivers fast and accurate MS² peak intensity prediction for multiple fragmentation methods, instruments and labeling techniques.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W295-W299, 2019 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31028400
19.
The Age of Data-Driven Proteomics: How Machine Learning Enables Novel Workflows.
Proteomics
; 20(21-22): e1900351, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32267083
20.
Removing the Hidden Data Dependency of DIA with Predicted Spectral Libraries.
Proteomics
; 20(3-4): e1900306, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31981311