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1.

RNA surveillance by uridylation-dependent RNA decay in Schizosaccharomyces pombe.

Chung, Christina Z; Jaramillo, Julia E; Ellis, Michael J; Bour, Daniel Y N; Seidl, Lauren E; Jo, David H S; Turk, Matthew A; Mann, Mitchell R; Bi, Yumin; Haniford, David B; Duennwald, Martin L; Heinemann, Ilka U.

Nucleic Acids Res ; 47(6): 3045-3057, 2019 04 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30715470

2.

A transposon-derived small RNA regulates gene expression in Salmonella Typhimurium.

Ellis, Michael J; Trussler, Ryan S; Charles, Onella; Haniford, David B.

Nucleic Acids Res ; 45(9): 5470-5486, 2017 May 19.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28335027

3.

Silent but deadly: IS200 promotes pathogenicity in Salmonella Typhimurium.

Ellis, Michael J; Carfrae, Lindsey A; Macnair, Craig R; Trussler, Ryan S; Brown, Eric D; Haniford, David B.

RNA Biol ; 15(2): 176-181, 2018 02 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29120256

4.

A cis-encoded sRNA, Hfq and mRNA secondary structure act independently to suppress IS200 transposition.

Ellis, Michael J; Trussler, Ryan S; Haniford, David B.

Nucleic Acids Res ; 43(13): 6511-27, 2015 Jul 27.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26044710

5.

Hfq binds directly to the ribosome-binding site of IS10 transposase mRNA to inhibit translation.

Ellis, Michael J; Trussler, Ryan S; Haniford, David B.

Mol Microbiol ; 96(3): 633-50, 2015 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25649688

6.

Hfq restructures RNA-IN and RNA-OUT and facilitates antisense pairing in the Tn10/IS10 system.

Ross, Joseph A; Ellis, Michael J; Hossain, Shahan; Haniford, David B.

RNA ; 19(5): 670-84, 2013 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23510801

7.

H-NS mediates the dissociation of a refractory protein-DNA complex during Tn10/IS10 transposition.

Liu, Danxu; Haniford, David B; Chalmers, Ronald M.

Nucleic Acids Res ; 39(15): 6660-8, 2011 Aug.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21565798

8.

Tn10/IS10 transposition is downregulated at the level of transposase expression by the RNA-binding protein Hfq.

Ross, Joseph A; Wardle, Simon J; Haniford, David B.

Mol Microbiol ; 78(3): 607-21, 2010 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20815820

9.

H-NS binds with high affinity to the Tn10 transpososome and promotes transpososome stabilization.

Wardle, Simon J; Chan, Amanda; Haniford, David B.

Nucleic Acids Res ; 37(18): 6148-60, 2009 Oct.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19696075

10.

The global bacterial regulator H-NS promotes transpososome formation and transposition in the Tn5 system.

Whitfield, Crystal R; Wardle, Simon J; Haniford, David B.

Nucleic Acids Res ; 37(2): 309-21, 2009 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19042975

11.

Structure/function analysis of the phosphatidylinositol-3-kinase domain of yeast tra1.

Mutiu, A Irina; Hoke, Stephen M T; Genereaux, Julie; Hannam, Carol; MacKenzie, Katherine; Jobin-Robitaille, Olivier; Guzzo, Julie; Côté, Jacques; Andrews, Brenda; Haniford, David B; Brandl, Christopher J.

Genetics ; 177(1): 151-66, 2007 Sep.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17660562

12.

Formation, characterization and partial purification of a Tn5 strand transfer complex.

Whitfield, Crystal R; Wardle, Simon J; Haniford, David B.

J Mol Biol ; 364(3): 290-301, 2006 Dec 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17014865

13.

Evolving Mistranslating tRNAs Through a Phenotypically Ambivalent Intermediate in Saccharomyces cerevisiae.

Berg, Matthew D; Hoffman, Kyle S; Genereaux, Julie; Mian, Safee; Trussler, Ryan S; Haniford, David B; O'Donoghue, Patrick; Brandl, Christopher J.

Genetics ; 206(4): 1865-1879, 2017 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28576863

14.

Tn10 transposase mutants with altered transpososome unfolding properties are defective in hairpin formation.

Humayun, Saima; Wardle, Simon J; Shilton, Brian H; Pribil, Patrick A; Liburd, Janine; Haniford, David B.

J Mol Biol ; 346(3): 703-16, 2005 Feb 25.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-15713457

15.

Riboregulation of bacterial and archaeal transposition.

Ellis, Michael J; Haniford, David B.

Wiley Interdiscip Rev RNA ; 7(3): 382-98, 2016 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26846462

16.

Mechanisms of metal ion action in Tn10 transposition.

Allingham, John S; Haniford, David B.

J Mol Biol ; 319(1): 53-65, 2002 May 24.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-12051936

17.

Target DNA bending is an important specificity determinant in target site selection in Tn10 transposition.

Pribil, Patrick A; Haniford, David B.

J Mol Biol ; 330(2): 247-59, 2003 Jul 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-12823965

18.

Transposons Tn10 and Tn5.

Haniford, David B; Ellis, Michael J.

Microbiol Spectr ; 3(1): MDNA3-0002-2014, 2015 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26104553

19.

Probing Hfq:RNA interactions with hydroxyl radical and RNase footprinting.

Ellis, Michael J; Trussler, Ryan S; Ross, Joseph A; Haniford, David B.

Methods Mol Biol ; 1259: 403-15, 2015.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25579599

20.

Tn5 transposition in Escherichia coli is repressed by Hfq and activated by over-expression of the small non-coding RNA SgrS.

Ross, Joseph A; Trussler, Ryan S; Black, Morgan D; McLellan, Crystal R; Haniford, David B.

Mob DNA ; 5(1): 27, 2014.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25506402

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