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1.

Allele-specific chromatin remodeling in the ZPBP2/GSDMB/ORMDL3 locus associated with the risk of asthma and autoimmune disease.

Verlaan, Dominique J; Berlivet, Soizik; Hunninghake, Gary M; Madore, Anne-Marie; Larivière, Mathieu; Moussette, Sanny; Grundberg, Elin; Kwan, Tony; Ouimet, Manon; Ge, Bing; Hoberman, Rose; Swiatek, Marcin; Dias, Joana; Lam, Kevin C L; Koka, Vonda; Harmsen, Eef; Soto-Quiros, Manuel; Avila, Lydiana; Celedón, Juan C; Weiss, Scott T; Dewar, Ken; Sinnett, Daniel; Laprise, Catherine; Raby, Benjamin A; Pastinen, Tomi; Naumova, Anna K.

Am J Hum Genet ; 85(3): 377-93, 2009 Sep.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19732864

2.

A probabilistic approach for SNP discovery in high-throughput human resequencing data.

Hoberman, Rose; Dias, Joana; Ge, Bing; Harmsen, Eef; Mayhew, Michael; Verlaan, Dominique J; Kwan, Tony; Dewar, Ken; Blanchette, Mathieu; Pastinen, Tomi.

Genome Res ; 19(9): 1542-52, 2009 Sep.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19605794

3.

Diagnosing duplications--can it be done?

Durand, Dannie; Hoberman, Rose.

Trends Genet ; 22(3): 156-64, 2006 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16442663

4.

Two plus two does not equal three: statistical tests for multiple genome comparison.

Raghupathy, Narayanan; Hoberman, Rose; Durand, Dannie.

J Bioinform Comput Biol ; 6(1): 1-22, 2008 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18324742

5.

The statistical analysis of spatially clustered genes under the maximum gap criterion.

Hoberman, Rose; Sankoff, David; Durand, Dannie.

J Comput Biol ; 12(8): 1083-102, 2005 Oct.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16241899

6.

Inferring property selection pressure from positional residue conservation.

Hoberman, Rose; Klein-Seetharaman, Judith; Rosenfeld, Roni.

Appl Bioinformatics ; 3(2-3): 167-79, 2004.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-15693742

7.

Targeted screening of cis-regulatory variation in human haplotypes.

Verlaan, Dominique J; Ge, Bing; Grundberg, Elin; Hoberman, Rose; Lam, Kevin C L; Koka, Vonda; Dias, Joana; Gurd, Scott; Martin, Nicolas W; Mallmin, Hans; Nilsson, Olof; Harmsen, Eef; Dewar, Ken; Kwan, Tony; Pastinen, Tomi.

Genome Res ; 19(1): 118-27, 2009 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18971308

8.

Global patterns of cis variation in human cells revealed by high-density allelic expression analysis.

Ge, Bing; Pokholok, Dmitry K; Kwan, Tony; Grundberg, Elin; Morcos, Lisanne; Verlaan, Dominique J; Le, Jennie; Koka, Vonda; Lam, Kevin C L; Gagné, Vincent; Dias, Joana; Hoberman, Rose; Montpetit, Alexandre; Joly, Marie-Michele; Harvey, Edward J; Sinnett, Daniel; Beaulieu, Patrick; Hamon, Robert; Graziani, Alexandru; Dewar, Ken; Harmsen, Eef; Majewski, Jacek; Göring, Harald H H; Naumova, Anna K; Blanchette, Mathieu; Gunderson, Kevin L; Pastinen, Tomi.

Nat Genet ; 41(11): 1216-22, 2009 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19838192

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