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1.
Curr Microbiol ; 69(3): 286-91, 2014 Sep.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24748440

RESUMEN

A Gram-negative, short-rod-shaped bacterial strain with gliding motility, designated as DG5A(T), was isolated from a rice field soil in South Korea. Phylogenic analysis using 16S rRNA gene sequence of the new isolate showed that strain DG5A(T) belong to the genus Spirosoma in the family Spirosomaceae, and the highest sequence similarities were 95.5 % with Spirosoma linguale DSM 74(T), 93.4 % with Spirosoma rigui WPCB118(T), 92.8 % with Spirosoma luteum SPM-10(T), 92.7 % with Spirosoma spitsbergense SPM-9(T), and 91.9 % with Spirosoma panaciterrae Gsoil 1519(T). Strain DG5A(T) revealed resistance to gamma and UV radiation. Chemotaxonomic data showed that the most abundant fatty acids were summed feature C(16:1) ω7c/C(16:1) ω6c (36.90 %), C(16:1) ω5c (29.55 %), and iso-C(15:0) (14.78 %), and the major polar lipid was phosphatidylethanolamine (PE). The DNA G+C content of strain DG5A(T) was 49.1 mol%. Together, the phenotypic, phylogenetic, and chemotaxonomic data supported that strain DG5A(T) presents a novel species of the genus Spirosoma, for which the name Spirosoma radiotolerans sp. nov., is proposed. The type strain is DG5A(T) (=KCTC 32455(T) = JCM19447(T)).


Asunto(s)
Cytophagaceae/clasificación , Cytophagaceae/aislamiento & purificación , Rayos gamma , Viabilidad Microbiana/efectos de la radiación , Microbiología del Suelo , Técnicas de Tipificación Bacteriana , Composición de Base , Análisis por Conglomerados , Cytophagaceae/fisiología , Cytophagaceae/efectos de la radiación , Citosol/química , ADN Bacteriano/química , ADN Bacteriano/genética , ADN Ribosómico/química , ADN Ribosómico/genética , Ácidos Grasos/análisis , Corea (Geográfico) , Locomoción , Microscopía Electrónica de Transmisión , Datos de Secuencia Molecular , Oryza , Fosfolípidos/análisis , Filogenia , ARN Ribosómico 16S/genética , Análisis de Secuencia de ADN , Rayos Ultravioleta
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