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1.

Predicting multiple conformations via sequence clustering and AlphaFold2.

Wayment-Steele, Hannah K; Ojoawo, Adedolapo; Otten, Renee; Apitz, Julia M; Pitsawong, Warintra; Hömberger, Marc; Ovchinnikov, Sergey; Colwell, Lucy; Kern, Dorothee.

Nature ; 625(7996): 832-839, 2024 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37956700

2.

From primordial clocks to circadian oscillators.

Pitsawong, Warintra; Pádua, Ricardo A P; Grant, Timothy; Hoemberger, Marc; Otten, Renee; Bradshaw, Niels; Grigorieff, Nikolaus; Kern, Dorothee.

Nature ; 616(7955): 183-189, 2023 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36949197

3.

A prolyl-isomerase mediates dopamine-dependent plasticity and cocaine motor sensitization.

Park, Joo Min; Hu, Jia-Hua; Milshteyn, Aleksandr; Zhang, Ping-Wu; Moore, Chester G; Park, Sungjin; Datko, Michael C; Domingo, Racquel D; Reyes, Cindy M; Wang, Xiaodong J; Etzkorn, Felicia A; Xiao, Bo; Szumlinski, Karen K; Kern, Dorothee; Linden, David J; Worley, Paul F.

Cell ; 154(3): 637-50, 2013 Aug 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23911326

4.

Structure determination of high-energy states in a dynamic protein ensemble.

Stiller, John B; Otten, Renee; Häussinger, Daniel; Rieder, Pascal S; Theobald, Douglas L; Kern, Dorothee.

Nature ; 603(7901): 528-535, 2022 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35236984

5.

A biophysical framework for double-drugging kinases.

Kim, Chansik; Ludewig, Hannes; Hadzipasic, Adelajda; Kutter, Steffen; Nguyen, Vy; Kern, Dorothee.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(34): e2304611120, 2023 08 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37590418

6.

Transient non-native hydrogen bonds promote activation of a signaling protein.

Gardino, Alexandra K; Villali, Janice; Kivenson, Aleksandr; Lei, Ming; Liu, Ce Feng; Steindel, Phillip; Eisenmesser, Elan Z; Labeikovsky, Wladimir; Wolf-Watz, Magnus; Clarkson, Michael W; Kern, Dorothee.

Cell ; 139(6): 1109-18, 2009 Dec 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20005804

7.

Cumulative mechanism of several major imatinib-resistant mutations in Abl kinase.

Hoemberger, Marc; Pitsawong, Warintra; Kern, Dorothee.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 117(32): 19221-19227, 2020 08 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32719139

8.

Allosteric modulation of a human protein kinase with monobodies.

Zorba, Adelajda; Nguyen, Vy; Koide, Akiko; Hoemberger, Marc; Zheng, Yuejiao; Kutter, Steffen; Kim, Chansik; Koide, Shohei; Kern, Dorothee.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 116(28): 13937-13942, 2019 07 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31239342

9.

From structure to mechanism: skiing the energy landscape.

Kern, Dorothee.

Nat Methods ; 18(5): 435-436, 2021 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33963338

10.

Antiparallel EmrE exports drugs by exchanging between asymmetric structures.

Morrison, Emma A; DeKoster, Gregory T; Dutta, Supratik; Vafabakhsh, Reza; Clarkson, Michael W; Bahl, Arjun; Kern, Dorothee; Ha, Taekjip; Henzler-Wildman, Katherine A.

Nature ; 481(7379): 45-50, 2011 Dec 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22178925

11.

A minor conformation of a lanthanide tag on adenylate kinase characterized by paramagnetic relaxation dispersion NMR spectroscopy.

Hass, Mathias A S; Liu, Wei-Min; Agafonov, Roman V; Otten, Renee; Phung, Lien A; Schilder, Jesika T; Kern, Dorothee; Ubbink, Marcellus.

J Biomol NMR ; 61(2): 123-36, 2015 Feb.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25563704

12.

Hidden alternative structures of proline isomerase essential for catalysis.

Fraser, James S; Clarkson, Michael W; Degnan, Sheena C; Erion, Renske; Kern, Dorothee; Alber, Tom.

Nature ; 462(7273): 669-73, 2009 Dec 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19956261

13.

A highly conserved cysteine of neuronal calcium-sensing proteins controls cooperative binding of Ca2+ to recoverin.

Ranaghan, Matthew J; Kumar, Ramasamy P; Chakrabarti, Kalyan S; Buosi, Vanessa; Kern, Dorothee; Oprian, Daniel D.

J Biol Chem ; 288(50): 36160-7, 2013 Dec 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24189072

14.

Dynamic personalities of proteins.

Henzler-Wildman, Katherine; Kern, Dorothee.

Nature ; 450(7172): 964-72, 2007 Dec 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18075575

15.

A hierarchy of timescales in protein dynamics is linked to enzyme catalysis.

Henzler-Wildman, Katherine A; Lei, Ming; Thai, Vu; Kerns, S Jordan; Karplus, Martin; Kern, Dorothee.

Nature ; 450(7171): 913-6, 2007 Dec 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18026087

16.

Intrinsic motions along an enzymatic reaction trajectory.

Henzler-Wildman, Katherine A; Thai, Vu; Lei, Ming; Ott, Maria; Wolf-Watz, Magnus; Fenn, Tim; Pozharski, Ed; Wilson, Mark A; Petsko, Gregory A; Karplus, Martin; Hübner, Christian G; Kern, Dorothee.

Nature ; 450(7171): 838-44, 2007 Dec 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18026086

17.

Intrinsic dynamics of an enzyme underlies catalysis.

Eisenmesser, Elan Z; Millet, Oscar; Labeikovsky, Wladimir; Korzhnev, Dmitry M; Wolf-Watz, Magnus; Bosco, Daryl A; Skalicky, Jack J; Kay, Lewis E; Kern, Dorothee.

Nature ; 438(7064): 117-21, 2005 Nov 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16267559

18.

Probing microsecond time scale dynamics in proteins by methyl (1)H Carr-Purcell-Meiboom-Gill relaxation dispersion NMR measurements. Application to activation of the signaling protein NtrC(r).

Otten, Renee; Villali, Janice; Kern, Dorothee; Mulder, Frans A A.

J Am Chem Soc ; 132(47): 17004-14, 2010 Dec 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21058670

19.

Response to Comment on "Ancient origins of allosteric activation in a Ser-Thr kinase".

Wilson, Christopher; Kern, Dorothee.

Science ; 370(6519)2020 11 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33214247

20.

Ancient origins of allosteric activation in a Ser-Thr kinase.

Hadzipasic, Adelajda; Wilson, Christopher; Nguyen, Vy; Kern, Nadja; Kim, Chansik; Pitsawong, Warintra; Villali, Janice; Zheng, Yuejiao; Kern, Dorothee.

Science ; 367(6480): 912-917, 2020 02 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32079772

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