Detalles de la búsqueda
1.
Impact of protein conformations on binding free energy calculations in the beta-secretase 1 system.
J Comput Chem
; 2024 May 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38725239
2.
Building Block-Centric Approach to DNA-Encoded Library Design.
J Chem Inf Model
; 2024 Jun 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38860710
3.
Current State of Open Source Force Fields in Protein-Ligand Binding Affinity Predictions.
J Chem Inf Model
; 2024 Jun 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38895959
4.
The SAMPL9 host-guest blind challenge: an overview of binding free energy predictive accuracy.
Phys Chem Chem Phys
; 26(12): 9207-9225, 2024 Mar 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38444308
5.
An optimized chemical-genetic method for cell-specific metabolic labeling of RNA.
Nat Methods
; 17(3): 311-318, 2020 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32015544
6.
To Design Scalable Free Energy Perturbation Networks, Optimal Is Not Enough.
J Chem Inf Model
; 63(6): 1776-1793, 2023 03 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36878475
7.
Building Block-Based Binding Predictions for DNA-Encoded Libraries.
J Chem Inf Model
; 63(16): 5120-5132, 2023 08 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37578123
8.
Pre-Exascale Computing of Protein-Ligand Binding Free Energies with Open Source Software for Drug Design.
J Chem Inf Model
; 62(5): 1172-1177, 2022 03 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35191702
9.
Open Force Field BespokeFit: Automating Bespoke Torsion Parametrization at Scale.
J Chem Inf Model
; 62(22): 5622-5633, 2022 11 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36351167
10.
Collaborative Assessment of Molecular Geometries and Energies from the Open Force Field.
J Chem Inf Model
; 62(23): 6094-6104, 2022 Dec 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36433835
11.
An overview of the SAMPL8 host-guest binding challenge.
J Comput Aided Mol Des
; 36(10): 707-734, 2022 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36229622
12.
Enhancing sampling of water rehydration upon ligand binding using variants of grand canonical Monte Carlo.
J Comput Aided Mol Des
; 36(10): 767-779, 2022 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36198874
13.
SAMPL7 protein-ligand challenge: A community-wide evaluation of computational methods against fragment screening and pose-prediction.
J Comput Aided Mol Des
; 36(4): 291-311, 2022 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35426591
14.
Percutaneous Ultrasound Guided Gastrostomy Tube Placement: A Prospective Cohort Trial.
J Intensive Care Med
; 37(5): 641-646, 2022 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33955290
15.
Research Priorities for Percutaneous Arteriovenous Fistula Creation in Patients with End-Stage Renal Disease: Proceedings and Recommendations from a Multidisciplinary Research Consensus Panel.
J Vasc Interv Radiol
; 32(8): 1240.e1-1240.e8, 2021 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34332723
16.
A Benchmark of Electrostatic Method Performance in Relative Binding Free Energy Calculations.
J Chem Inf Model
; 61(3): 1048-1052, 2021 03 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33686853
17.
SAMPL7 Host-Guest Challenge Overview: assessing the reliability of polarizable and non-polarizable methods for binding free energy calculations.
J Comput Aided Mol Des
; 35(1): 1-35, 2021 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33392951
18.
Overview of the SAMPL6 pKa challenge: evaluating small molecule microscopic and macroscopic pKa predictions.
J Comput Aided Mol Des
; 35(2): 131-166, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33394238
19.
Improving small molecule force fields by identifying and characterizing small molecules with inconsistent parameters.
J Comput Aided Mol Des
; 35(3): 271-284, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33506360
20.
Automated high throughput pKa and distribution coefficient measurements of pharmaceutical compounds for the SAMPL8 blind prediction challenge.
J Comput Aided Mol Des
; 35(11): 1141-1155, 2021 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34714468