Detalles de la búsqueda
1.
Systematic assessment of long-read RNA-seq methods for transcript identification and quantification.
Nat Methods
; 2024 Jun 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38849569
2.
Spruce giga-genomes: structurally similar yet distinctive with differentially expanding gene families and rapidly evolving genes.
Plant J
; 111(5): 1469-1485, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35789009
3.
RNA-Bloom enables reference-free and reference-guided sequence assembly for single-cell transcriptomes.
Genome Res
; 30(8): 1191-1200, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32817073
4.
RResolver: efficient short-read repeat resolution within ABySS.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 246, 2022 Jun 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35729491
5.
Fusion-Bloom: fusion detection in assembled transcriptomes.
Bioinformatics
; 36(7): 2256-2257, 2020 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31790154
6.
Recurrent tumor-specific regulation of alternative polyadenylation of cancer-related genes.
BMC Genomics
; 19(1): 536, 2018 Jul 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30005633
7.
Subgroup-specific structural variation across 1,000 medulloblastoma genomes.
Nature
; 488(7409): 49-56, 2012 Aug 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22832581
8.
BioBloom tools: fast, accurate and memory-efficient host species sequence screening using bloom filters.
Bioinformatics
; 30(23): 3402-4, 2014 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25143290
9.
Complete genomic landscape of a recurring sporadic parathyroid carcinoma.
J Pathol
; 230(3): 249-60, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23616356
10.
ntEmbd: Deep learning embedding for nucleotide sequences.
bioRxiv
; 2024 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38746190
11.
Barnacle: detecting and characterizing tandem duplications and fusions in transcriptome assemblies.
BMC Genomics
; 14: 550, 2013 Aug 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23941359
12.
Characterization and simulation of metagenomic nanopore sequencing data with Meta-NanoSim.
Gigascience
; 122023 03 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36939007
13.
Linear time complexity de novo long read genome assembly with GoldRush.
Nat Commun
; 14(1): 2906, 2023 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37217507
14.
Reference-free assembly of long-read transcriptome sequencing data with RNA-Bloom2.
Nat Commun
; 14(1): 2940, 2023 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37217540
15.
Prevalence and Characteristics of Peripapillary Gamma Zone in Children With Different Refractive Status: The Hong Kong Children Eye Study.
Invest Ophthalmol Vis Sci
; 64(4): 4, 2023 04 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37022704
16.
Genomic structures and regulation patterns at HPV integration sites in cervical cancer.
bioRxiv
; 2023 Nov 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37961641
17.
Seasonal and sex-dependent gene expression in emu (Dromaius novaehollandiae) fat tissues.
Sci Rep
; 12(1): 9419, 2022 06 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35676317
18.
Mining Amphibian and Insect Transcriptomes for Antimicrobial Peptide Sequences with rAMPage.
Antibiotics (Basel)
; 11(7)2022 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35884206
19.
RNA-Scoop: interactive visualization of transcripts in single-cell transcriptomes.
NAR Genom Bioinform
; 3(4): lqab105, 2021 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34859209
20.
A Scalable Strand-Specific Protocol Enabling Full-Length Total RNA Sequencing From Single Cells.
Front Genet
; 12: 665888, 2021.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34149808