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1.
J Endotoxin Res ; 11(1): 41-6, 2005.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-15826377

RESUMEN

Peptidoglycan recognition proteins (PGRPs) are pattern recognition receptors of the innate immune system that bind, and in some cases hydrolyse, bacterial peptidoglycans (PGNs). We determined the crystal structure of the C-terminal PGN-binding domain of human PGRP-Ialpha in complex with a muramyl tripeptide representing the conserved core of lysine-type PGNs. The peptide stem of the ligand is buried at the deep end of a long binding groove, with N-acetylmuramic acid situated in the middle of the groove, whose shallow end could accommodate N-acetylglucosamine. Both peptide and glycan moieties are essential for binding by PGRPs. Conservation of key PGN-contacting residues indicates that all PGRPs employ this basic PGN-binding mode. The structure identifies variable residues that likely mediate discrimination between lysine- and diaminopimelic acid-type PGNs. In addition, we propose a mechanism for PGN hydrolysis by Zn2+-containing catalytic PGRPs.


Asunto(s)
Acetilmuramil-Alanil-Isoglutamina/análogos & derivados , Acetilmuramil-Alanil-Isoglutamina/metabolismo , Proteínas Portadoras/metabolismo , Cristalografía por Rayos X , Proteínas de Drosophila/metabolismo , Bacterias Grampositivas/química , Secuencia de Aminoácidos , Sitios de Unión , Proteínas Portadoras/química , Secuencia Conservada , Disulfuros/química , Glicina/química , Humanos , Enlace de Hidrógeno , Ligandos , Modelos Moleculares , Estructura Molecular , Unión Proteica , Estructura Secundaria de Proteína , Estructura Terciaria de Proteína
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