Detalles de la búsqueda
1.
To assemble or not to assemble: metagenomic profiling of microbially mediated biogeochemical pathways in complex communities.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36575570
2.
Distinct Ecological Processes Mediate Domain-Level Differentiation in Microbial Spatial Scaling.
Appl Environ Microbiol
; 89(3): e0209622, 2023 03 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36815790
3.
Random sampling in metagenomic sequencing leads to overestimated spatial scaling of microbial diversity.
Environ Microbiol
; 22(6): 2140-2149, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32128982
4.
NCycDB: a curated integrative database for fast and accurate metagenomic profiling of nitrogen cycling genes.
Bioinformatics
; 35(6): 1040-1048, 2019 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30165481
5.
Taxonomic and Functional Analyses of the Supragingival Microbiome from Caries-Affected and Caries-Free Hosts.
Microb Ecol
; 75(2): 543-554, 2018 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28932895
6.
Dynamic Succession of Groundwater Sulfate-Reducing Communities during Prolonged Reduction of Uranium in a Contaminated Aquifer.
Environ Sci Technol
; 51(7): 3609-3620, 2017 04 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28300407
7.
HuMiChip2 for strain level identification and functional profiling of human microbiomes.
Appl Microbiol Biotechnol
; 101(1): 423-435, 2017 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27734124
8.
Gene content dissimilarity for subclassification of highly similar microbial strains.
BMC Genomics
; 17: 647, 2016 08 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27530250
9.
Network succession reveals the importance of competition in response to emulsified vegetable oil amendment for uranium bioremediation.
Environ Microbiol
; 18(1): 205-18, 2016 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26177312
10.
Biogeographic patterns of soil diazotrophic communities across six forests in North America.
Mol Ecol
; 25(12): 2937-48, 2016 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27085668
11.
The Diversity and Co-occurrence Patterns of N2-Fixing Communities in a CO2-Enriched Grassland Ecosystem.
Microb Ecol
; 71(3): 604-15, 2016 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26280746
12.
Strain/species identification in metagenomes using genome-specific markers.
Nucleic Acids Res
; 42(8): e67, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24523352
13.
Fungal communities respond to long-term CO2 elevation by community reassembly.
Appl Environ Microbiol
; 81(7): 2445-54, 2015 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25616796
14.
Phasing amplicon sequencing on Illumina Miseq for robust environmental microbial community analysis.
BMC Microbiol
; 15: 125, 2015 Jun 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26084274
15.
Soil microbial community responses to a decade of warming as revealed by comparative metagenomics.
Appl Environ Microbiol
; 80(5): 1777-86, 2014 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24375144
16.
The Thermoanaerobacter glycobiome reveals mechanisms of pentose and hexose co-utilization in bacteria.
PLoS Genet
; 7(10): e1002318, 2011 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22022280
17.
Metagenomic-based discovery and comparison of the lignin degrading potential of microbiomes in aquatic and terrestrial ecosystems via the LCdb database.
Mol Ecol Resour
; 24(5): e13950, 2024 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38567644
18.
The mechanism of low blue light-induced leaf senescence mediated by GmCRY1s in soybean.
Nat Commun
; 15(1): 798, 2024 Jan 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38280892
19.
Strain/species-specific probe design for microbial identification microarrays.
Appl Environ Microbiol
; 79(16): 5085-8, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23747703
20.
Combined genomics and experimental analyses of respiratory characteristics of Shewanella putrefaciens W3-18-1.
Appl Environ Microbiol
; 79(17): 5250-7, 2013 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23811511