Detalles de la búsqueda
1.
TopDownApp: An open and modular platform for analysis and visualisation of top-down proteomics data.
Proteomics
; 24(3-4): e2200403, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37787899
2.
The PRIDE database resources in 2022: a hub for mass spectrometry-based proteomics evidences.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D543-D552, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34723319
3.
Expression Atlas update: gene and protein expression in multiple species.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D129-D140, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34850121
4.
Proteomics Standards Initiative at Twenty Years: Current Activities and Future Work.
J Proteome Res
; 22(2): 287-301, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36626722
5.
OpenMS 3 enables reproducible analysis of large-scale mass spectrometry data.
Nat Methods
; 21(3): 365-367, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38366242
6.
OpenPepXL: An Open-Source Tool for Sensitive Identification of Cross-Linked Peptides in XL-MS.
Mol Cell Proteomics
; 19(12): 2157-2168, 2020 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33067342
7.
The PRIDE database and related tools and resources in 2019: improving support for quantification data.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D442-D450, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30395289
8.
ThermoRawFileParser: Modular, Scalable, and Cross-Platform RAW File Conversion.
J Proteome Res
; 19(1): 537-542, 2020 01 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31755270
9.
Recognizing millions of consistently unidentified spectra across hundreds of shotgun proteomics datasets.
Nat Methods
; 13(8): 651-656, 2016 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27493588
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OpenMS: a flexible open-source software platform for mass spectrometry data analysis.
Nat Methods
; 13(9): 741-8, 2016 08 30.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27575624
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The mzIdentML Data Standard Version 1.2, Supporting Advances in Proteome Informatics.
Mol Cell Proteomics
; 16(7): 1275-1285, 2017 07.
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| MEDLINE | ID: mdl-28515314
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Expanding the Use of Spectral Libraries in Proteomics.
J Proteome Res
; 17(12): 4051-4060, 2018 12 07.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30270626
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ImmunoNodes - graphical development of complex immunoinformatics workflows.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 242, 2017 May 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28482806
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Proteomics Standards Initiative: Fifteen Years of Progress and Future Work.
J Proteome Res
; 16(12): 4288-4298, 2017 12 01.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28849660
15.
The Human Proteome Organization-Proteomics Standards Initiative Quality Control Working Group: Making Quality Control More Accessible for Biological Mass Spectrometry.
Anal Chem
; 89(8): 4474-4479, 2017 04 18.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28318237
16.
FRED 2: an immunoinformatics framework for Python.
Bioinformatics
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153717
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Personalized peptide vaccine-induced immune response associated with long-term survival of a metastatic cholangiocarcinoma patient.
J Hepatol
; 65(4): 849-855, 2016 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27397612
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The mzTab data exchange format: communicating mass-spectrometry-based proteomics and metabolomics experimental results to a wider audience.
Mol Cell Proteomics
; 13(10): 2765-75, 2014 Oct.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24980485
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qcML: an exchange format for quality control metrics from mass spectrometry experiments.
Mol Cell Proteomics
; 13(8): 1905-13, 2014 Aug.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24760958
20.
Workflows for automated downstream data analysis and visualization in large-scale computational mass spectrometry.
Proteomics
; 15(8): 1443-7, 2015 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25604327