Draft genome sequence of first Vibrio diabolicus in Mexico strain InDRE-D1-M1, an emergent threat.

INTRODUCTION: The complete genome of the marine environmental bacterium Vibrio diabolicus isolated from raw shrimp in the city of Guadalajara in the state of Jalisco in Mexico is reported here. METHODOLOGY: Vibrio spp. it was isolated and identified using standard microbiological and molecular techniques. Whole genome sequencing was performed using the Miseq system (Illumina, USA). RESULTS: The Multi Locus Sequence Typing profile of the isolated Vibrio bacteria coincided only with 4 specific loci (atpA, gyrB, pyrH and recA) and with a total coverage of the species belonging to Vibrio spp. Analysis of the complete genome of the Vibrio isolate and other closely related species, using the genomic fingerprints of the Virtual Analysis Method for PHylogenomic fingerprint estimation (VAMPHyRe) software, revealed the clustering of this species among the clade Vibrio diabolicus. The antibiogram revealed that this strain of Vibrio diabolicus is resistant to ampicillin, which is consistent with the bioinformatic finding of the ß-lactamase enzyme that hydrolyzes carbenicillin class A. CONCLUSIONS: This study demonstrated that the environmental marine bacterium Vibrio diabolicus contains carrier genes associated with pathogenicity and ecological function, which could represent a threat to public health.

Serotipos de Salmonella identificados en los servicios de salud de México / Salmonella serotypes isolated in Mexico's health services

Objetivo. Dar a conocer las variaciones de los serotipos de cepas de Salmonella aislados en diversos laboratorios públicos y privados de la República mexicana, así como en el del Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos (InDRE). Material y métodos. Se analizaron los serotipos de 24 394 cepas de Salmonella aisladas de diversas fuentes por los laboratorios de salud pública y privados de México, entre 1972 y 1999, 15 843 (64.9 por ciento) de origen humano y 8 551(35.1 por ciento) de origen no humano siguiendo el esquema de Kauffmann-White y utilizando antisueros producidos en el InDRE, de acuerdo con los lineamientos del Centro de Control y Prevención de Enfermedades, Atlanta (GA), de los Estados Unidos de América. Resultados. Se identificaron 199 serotipos, el más frecuente en muestras clínicas fue S. Typhimurium (20.4 por ciento) y, en segundo lugar, S. Enteritidis (18.3 por ciento). En este trabajo se muestra como S. Enteritidis tuvo un aumento gradual y desplazó a S. Typhimurium en los aislamientos desde 1991, y a la fecha es el serotipo que más se aísla. En cambio, en muestras no humanas el serotipo aislado con mayor frecuencia fue S. Derby (13.8 por ciento), seguido por S. Anatum (8.5 por ciento). Conclusiones. Los serotipos más frecuentes en México, tanto en muestras humanas como no humanas son: S. Typhimurium, S. Enteritidis, S. Derby, S. Agona y S. Anatum. Desde el punto de vista epidemiológico es necesario conocer cuáles son los serotipos circulantes y los de nueva introducción para poder determinar las acciones de prevención requeridas para los casos.