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Nat Commun ; 12(1): 2311, 2021 04 19.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33875655

RESUMO

Selective vulnerability of different brain regions is seen in many neurodegenerative disorders. The hippocampus and cortex are selectively vulnerable in Alzheimer's disease (AD), however the degree of involvement of the different brain regions differs among patients. We classified corticolimbic patterns of neurofibrillary tangles in postmortem tissue to capture extreme and representative phenotypes. We combined bulk RNA sequencing with digital pathology to examine hippocampal vulnerability in AD. We identified hippocampal gene expression changes associated with hippocampal vulnerability and used machine learning to identify genes that were associated with AD neuropathology, including SERPINA5, RYBP, SLC38A2, FEM1B, and PYDC1. Further histologic and biochemical analyses suggested SERPINA5 expression is associated with tau expression in the brain. Our study highlights the importance of embracing heterogeneity of the human brain in disease to identify disease-relevant gene expression.


Assuntos
Doença de Alzheimer/genética , Córtex Cerebral/metabolismo , Perfilação da Expressão Gênica/métodos , Hipocampo/metabolismo , Idoso , Idoso de 80 Anos ou mais , Doença de Alzheimer/diagnóstico , Autopsia , Córtex Cerebral/patologia , Feminino , Hipocampo/patologia , Humanos , Aprendizado de Máquina , Masculino , Emaranhados Neurofibrilares/genética , Emaranhados Neurofibrilares/metabolismo , Inibidor da Proteína C/genética , Inibidor da Proteína C/metabolismo , RNA-Seq/métodos , Proteínas tau/genética , Proteínas tau/metabolismo
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