Detalhe da pesquisa
1.
Regulation of adenylyl cyclase 5 in striatal neurons confers the ability to detect coincident neuromodulatory signals.
PLoS Comput Biol
; 15(10): e1007382, 2019 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31665146
2.
Influence of Transmembrane Helix Mutations on Cytochrome P450-Membrane Interactions and Function.
Biophys J
; 116(3): 419-432, 2019 02 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30658838
3.
KBbox: A Toolbox of Computational Methods for Studying the Kinetics of Molecular Binding.
J Chem Inf Model
; 59(9): 3630-3634, 2019 09 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31381336
4.
Differing Membrane Interactions of Two Highly Similar Drug-Metabolizing Cytochrome P450 Isoforms: CYP 2C9 and CYP 2C19.
Int J Mol Sci
; 20(18)2019 Sep 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31487853
5.
webSDA: a web server to simulate macromolecular diffusional association.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W220-4, 2015 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25883142
6.
Comparative electrostatic analysis of adenylyl cyclase for isoform dependent regulation properties.
Proteins
; 84(12): 1844-1858, 2016 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27667304
7.
SDA 7: A modular and parallel implementation of the simulation of diffusional association software.
J Comput Chem
; 36(21): 1631-45, 2015 Aug 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26123630
8.
Free Energy Calculations using a Swarm-Enhanced Sampling Molecular Dynamics Approach.
Chemphyschem
; 16(15): 3233-41, 2015 Oct 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26418190
9.
Comparative electrostatic analysis of adenylyl cyclase for isoform dependent regulation properties.
Proteins
; 87(7): 619-620, 2019 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31152609
10.
Exploring protein kinase conformation using swarm-enhanced sampling molecular dynamics.
J Chem Inf Model
; 54(10): 2764-75, 2014 Oct 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25178116
11.
Brownian Dynamics Simulations of Proteins in the Presence of Surfaces: Long-Range Electrostatics and Mean-Field Hydrodynamics.
J Chem Theory Comput
; 17(6): 3510-3524, 2021 Jun 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33784462
12.
Simulation of the Positive Inotropic Peptide S100A1ct in Aqueous Environment by Gaussian Accelerated Molecular Dynamics.
J Phys Chem B
; 125(18): 4654-4666, 2021 05 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33944558
13.
The Effect of Force-Field Parameters on Cytochrome P450-Membrane Interactions: Structure and Dynamics.
Sci Rep
; 10(1): 7284, 2020 04 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32350331
14.
Identification of Rare Lewis Oligosaccharide Conformers in Aqueous Solution Using Enhanced Sampling Molecular Dynamics.
J Phys Chem B
; 122(9): 2462-2474, 2018 03 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29419301
15.
New approaches for computing ligand-receptor binding kinetics.
Curr Opin Struct Biol
; 49: 1-10, 2018 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29132080
16.
Ab Initio Protein Folding Using a Cooperative Swarm of Molecular Dynamics Trajectories.
J Chem Theory Comput
; 6(7): 1925-30, 2010 Jul 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26615921
17.
Molecular dynamics simulations of Aß fibril interactions with ß-sheet breaker peptides.
Peptides
; 31(11): 2100-8, 2010 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20691234