Detalhe da pesquisa
1.
MUMmer4: A fast and versatile genome alignment system.
PLoS Comput Biol
; 14(1): e1005944, 2018 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29373581
2.
GAGE: A critical evaluation of genome assemblies and assembly algorithms.
Genome Res
; 22(3): 557-67, 2012 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22147368
3.
Hawkeye and AMOS: visualizing and assessing the quality of genome assemblies.
Brief Bioinform
; 14(2): 213-24, 2013 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22199379
4.
The draft genome of the transgenic tropical fruit tree papaya (Carica papaya Linnaeus).
Nature
; 452(7190): 991-6, 2008 Apr 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18432245
5.
Gene prediction with Glimmer for metagenomic sequences augmented by classification and clustering.
Nucleic Acids Res
; 40(1): e9, 2012 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22102569
6.
Assembly of large genomes using second-generation sequencing.
Genome Res
; 20(9): 1165-73, 2010 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20508146
7.
Two new complete genome sequences offer insight into host and tissue specificity of plant pathogenic Xanthomonas spp.
J Bacteriol
; 193(19): 5450-64, 2011 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21784931
8.
Sim4cc: a cross-species spliced alignment program.
Nucleic Acids Res
; 37(11): e80, 2009 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19429899
9.
Genome sequence of the dioxin-mineralizing bacterium Sphingomonas wittichii RW1.
J Bacteriol
; 192(22): 6101-2, 2010 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20833805
10.
Aggressive assembly of pyrosequencing reads with mates.
Bioinformatics
; 24(24): 2818-24, 2008 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18952627
11.
Macronuclear genome sequence of the ciliate Tetrahymena thermophila, a model eukaryote.
PLoS Biol
; 4(9): e286, 2006 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16933976
12.
Genome sequence and rapid evolution of the rice pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A.
BMC Genomics
; 9: 204, 2008 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18452608
13.
Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer.
Bioinformatics
; 23(6): 673-9, 2007 Mar 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17237039
14.
High-throughput sequence alignment using Graphics Processing Units.
BMC Bioinformatics
; 8: 474, 2007 Dec 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18070356
15.
Minimus: a fast, lightweight genome assembler.
BMC Bioinformatics
; 8: 64, 2007 Feb 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17324286
16.
New var reconstruction algorithm exposes high var sequence diversity in a single geographic location in Mali.
Genome Med
; 9(1): 30, 2017 03 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28351419
17.
PROBEmer: A web-based software tool for selecting optimal DNA oligos.
Nucleic Acids Res
; 31(13): 3746-50, 2003 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-12824409
18.
Fast algorithms for large-scale genome alignment and comparison.
Nucleic Acids Res
; 30(11): 2478-83, 2002 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-12034836
19.
Improving the Arabidopsis genome annotation using maximal transcript alignment assemblies.
Nucleic Acids Res
; 31(19): 5654-66, 2003 Oct 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-14500829
20.
Efficient decoding algorithms for generalized hidden Markov model gene finders.
BMC Bioinformatics
; 6: 16, 2005 Jan 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15667658