Detalhe da pesquisa
1.
ProteinTools: a toolkit to analyze protein structures.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W559-W566, 2021 07 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34019657
2.
Protlego: a Python package for the analysis and design of chimeric proteins.
Bioinformatics
; 37(19): 3182-3189, 2021 Oct 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33901273
3.
Insights from Fragment Hit Binding Assays by Molecular Simulations.
J Chem Inf Model
; 55(10): 2200-5, 2015 Oct 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26376295
4.
Computational modeling of an epidermal growth factor receptor single-mutation resistance to cetuximab in colorectal cancer treatment.
J Chem Inf Model
; 53(12): 3123-6, 2013 Dec 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24219403
5.
Exploring the Protein Sequence Space with Global Generative Models.
Cold Spring Harb Perspect Biol
; 15(11)2023 Nov 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37848247
6.
From sequence to function through structure: Deep learning for protein design.
Comput Struct Biotechnol J
; 21: 238-250, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36544476
7.
Statistical Analysis and Tokenization of Epitopes to Construct Artificial Neoepitope Libraries.
ACS Synth Biol
; 12(10): 2812-2818, 2023 10 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37703075
8.
ProtGPT2 is a deep unsupervised language model for protein design.
Nat Commun
; 13(1): 4348, 2022 07 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35896542
9.
Correction to Insights from Fragment Hit Binding Assays by Molecular Simulations.
J Chem Inf Model
; 56(10): 2123, 2016 10 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27661194
10.
A comprehensive binding study illustrates ligand recognition in the periplasmic binding protein PotF.
Structure
; 29(5): 433-443.e4, 2021 05 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33406388
11.
Fuzzle 2.0: Ligand Binding in Natural Protein Building Blocks.
Front Mol Biosci
; 8: 715972, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34485385
12.
Identification and Analysis of Natural Building Blocks for Evolution-Guided Fragment-Based Protein Design.
J Mol Biol
; 432(13): 3898-3914, 2020 06 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32330481
13.
What does it take for an 'AlphaFold Moment' in functional protein engineering and design?
Nat Biotechnol
; 42(2): 173-174, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38361055
14.
Author Correction: Dopamine D3 receptor antagonist reveals a cryptic pocket in aminergic GPCRs.
Sci Rep
; 9(1): 6076, 2019 Apr 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30967561
15.
Strategies for designing non-natural enzymes and binders.
Curr Opin Chem Biol
; 47: 67-76, 2018 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30248579
16.
Dopamine D3 receptor antagonist reveals a cryptic pocket in aminergic GPCRs.
Sci Rep
; 8(1): 897, 2018 01 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29343833
17.
Dreaming ideal protein structures.
Nat Biotechnol
; 40(2): 171-172, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35075248
18.
Binding Kinetics in Drug Discovery.
Mol Inform
; 35(6-7): 216-26, 2016 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27492236
19.
Multibody cofactor and substrate molecular recognition in the myo-inositol monophosphatase enzyme.
Sci Rep
; 6: 30275, 2016 07 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27440438
20.
Emergence of Multiple EGFR Extracellular Mutations during Cetuximab Treatment in Colorectal Cancer.
Clin Cancer Res
; 21(9): 2157-66, 2015 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25623215