Detalhe da pesquisa
1.
Constraining the oxygen requirements for modern microbial eukaryote diversity.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 121(2): e2303754120, 2024 Jan 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38165897
2.
Comparative genomics reveals electron transfer and syntrophic mechanisms differentiating methanotrophic and methanogenic archaea.
PLoS Biol
; 20(1): e3001508, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34986141
3.
The cyanobacterium Prochlorococcus has divergent light-harvesting antennae and may have evolved in a low-oxygen ocean.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(11)2021 03 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33707213
4.
Emerging enzyme surface display systems for waste resource recovery.
Environ Microbiol
; 25(2): 241-249, 2023 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36369958
5.
Leveraging heterogeneous network embedding for metabolic pathway prediction.
Bioinformatics
; 37(6): 822-829, 2021 05 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33305310
6.
Hive Panel Explorer: an interactive network visualization tool.
Bioinformatics
; 37(3): 436-437, 2021 04 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32717050
7.
An integrated, modular approach to data science education in microbiology.
PLoS Comput Biol
; 17(2): e1008661, 2021 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33630850
8.
TreeSAPP: the Tree-based Sensitive and Accurate Phylogenetic Profiler.
Bioinformatics
; 36(18): 4706-4713, 2020 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32637989
9.
Metabolic pathway inference using multi-label classification with rich pathway features.
PLoS Comput Biol
; 16(10): e1008174, 2020 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33001968
10.
Prospecting for microbial α-N-acetylgalactosaminidases yields a new class of GH31 O-glycanase.
J Biol Chem
; 294(44): 16400-16415, 2019 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31530641
11.
Structural and mechanistic analysis of a ß-glycoside phosphorylase identified by screening a metagenomic library.
J Biol Chem
; 293(9): 3451-3467, 2018 03 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29317495
12.
Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter.
Nature
; 499(7459): 431-7, 2013 Jul 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23851394
13.
Integrating biogeochemistry with multiomic sequence information in a model oxygen minimum zone.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 113(40): E5925-E5933, 2016 10 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27655888
14.
Ammonium and nitrite oxidation at nanomolar oxygen concentrations in oxygen minimum zone waters.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 113(38): 10601-6, 2016 09 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27601665
15.
LCA*: an entropy-based measure for taxonomic assignment within assembled metagenomes.
Bioinformatics
; 32(23): 3535-3542, 2016 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27515739
16.
Metaproteomics reveals differential modes of metabolic coupling among ubiquitous oxygen minimum zone microbes.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(31): 11395-400, 2014 Aug 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25053816
17.
Metagenomic scaffolds enable combinatorial lignin transformation.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(28): 10143-8, 2014 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24982175
18.
MetaPathways v2.5: quantitative functional, taxonomic and usability improvements.
Bioinformatics
; 31(20): 3345-7, 2015 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26076725
19.
Prevalent genome streamlining and latitudinal divergence of planktonic bacteria in the surface ocean.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(28): 11463-8, 2013 Jul 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23801761
20.
Rare taxa have potential to make metabolic contributions in enhanced biological phosphorus removal ecosystems.
Environ Microbiol
; 17(12): 4979-93, 2015 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25857222