Detalhe da pesquisa
1.
NetActivity enhances transcriptional signals by combining gene expression into robust gene set activity scores through interpretable autoencoders.
Nucleic Acids Res
; 52(9): e44, 2024 May 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38597610
2.
GeNNius: an ultrafast drug-target interaction inference method based on graph neural networks.
Bioinformatics
; 40(1)2024 01 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38134424
3.
Cellular plasticity balances the metabolic and proliferation dynamics of a regenerating liver.
Genome Res
; 31(4): 576-591, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33649154
4.
Microglia and astrocyte activation is region-dependent in the α-synuclein mouse model of Parkinson's disease.
Glia
; 71(3): 571-587, 2023 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36353934
5.
JIND: joint integration and discrimination for automated single-cell annotation.
Bioinformatics
; 38(9): 2488-2495, 2022 04 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35253844
6.
GPress: a framework for querying general feature format (GFF) files and expression files in a compressed form.
Bioinformatics
; 36(18): 4810-4812, 2020 09 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32609343
7.
Comparison of single and module-based methods for modeling gene regulatory networks.
Bioinformatics
; 36(2): 558-567, 2020 01 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31287491
8.
GABAC: an arithmetic coding solution for genomic data.
Bioinformatics
; 36(7): 2275-2277, 2020 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31830243
9.
SPRING: a next-generation compressor for FASTQ data.
Bioinformatics
; 35(15): 2674-2676, 2019 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30535063
10.
Cell-type specific polysome profiling from mammalian tissues.
Methods
; 155: 131-139, 2019 02 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30500367
11.
Effect of lossy compression of quality scores on variant calling.
Brief Bioinform
; 18(2): 183-194, 2017 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26966283
12.
CALQ: compression of quality values of aligned sequencing data.
Bioinformatics
; 34(10): 1650-1658, 2018 05 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29186284
13.
FaStore: a space-saving solution for raw sequencing data.
Bioinformatics
; 34(16): 2748-2756, 2018 08 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29617939
14.
Comment on: 'ERGC: an efficient referential genome compression algorithm'.
Bioinformatics
; 32(7): 1115-7, 2016 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26615213
15.
GTRAC: fast retrieval from compressed collections of genomic variants.
Bioinformatics
; 32(17): i479-i486, 2016 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27587665
16.
iDoComp: a compression scheme for assembled genomes.
Bioinformatics
; 31(5): 626-33, 2015 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25344501
17.
QVZ: lossy compression of quality values.
Bioinformatics
; 31(19): 3122-9, 2015 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26026138
18.
QVZ: lossy compression of quality values.
Bioinformatics
; 34(1): 179, 2018 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29177464
19.
Genie: the first open-source ISO/IEC encoder for genomic data.
Commun Biol
; 7(1): 553, 2024 May 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38724695
20.
Efficient and safe therapeutic use of paired Cas9-nickases for primary hyperoxaluria type 1.
EMBO Mol Med
; 16(1): 112-131, 2024 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38182795