Detalhe da pesquisa
1.
Analysis of nanopore data using hidden Markov models.
Bioinformatics
; 31(12): 1897-903, 2015 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25649617
2.
Error rates for nanopore discrimination among cytosine, methylcytosine, and hydroxymethylcytosine along individual DNA strands.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(47): 18910-5, 2013 Nov 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24167260
3.
Altering under-represented DNA sequences elevates bacterial transformation efficiency.
mBio
; : e0210523, 2023 Oct 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37905805
4.
Identification of prokaryotic small proteins using a comparative genomic approach.
Bioinformatics
; 27(13): 1765-71, 2011 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21551138
5.
Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega.
Mol Syst Biol
; 7: 539, 2011 Oct 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21988835
6.
Identification of a chemoreceptor zinc-binding domain common to cytoplasmic bacterial chemoreceptors.
J Bacteriol
; 193(17): 4338-45, 2011 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21725005
7.
Improving protein secondary structure prediction using a simple k-mer model.
Bioinformatics
; 26(5): 596-602, 2010 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20130034
8.
SAM-T08, HMM-based protein structure prediction.
Nucleic Acids Res
; 37(Web Server issue): W492-7, 2009 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19483096
9.
Pokefind: a novel topological filter for use with protein structure prediction.
Bioinformatics
; 25(12): i281-8, 2009 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19478000
10.
Model quality assessment using distance constraints from alignments.
Proteins
; 75(3): 540-9, 2009 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19003987
11.
Applying undertaker cost functions to model quality assessment.
Proteins
; 75(3): 550-5, 2009 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19004017
12.
Applying Undertaker to quality assessment.
Proteins
; 77 Suppl 9: 191-5, 2009.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19639637
13.
Improving physical realism, stereochemistry, and side-chain accuracy in homology modeling: Four approaches that performed well in CASP8.
Proteins
; 77 Suppl 9: 114-22, 2009.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19768677
14.
PREDICT-2ND: a tool for generalized protein local structure prediction.
Bioinformatics
; 24(21): 2453-9, 2008 Nov 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18757875
15.
Contact prediction using mutual information and neural nets.
Proteins
; 69 Suppl 8: 159-64, 2007.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17932918
16.
Fallacy of the Unique Genome: Sequence Diversity within Single Helicobacter pylori Strains.
mBio
; 8(1)2017 02 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28223462
17.
SAM-T04: what is new in protein-structure prediction for CASP6.
Proteins
; 61 Suppl 7: 135-142, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16187355
18.
Methods of translating NMR proton distances into their corresponding heavy atom distances for protein structure prediction with limited experimental data.
Protein Eng Des Sel
; 18(12): 597-605, 2005 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16246822
19.
Evaluation of local structure alphabets based on residue burial.
Proteins
; 55(3): 508-18, 2004 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15103615
20.
Hidden Markov models that use predicted local structure for fold recognition: alphabets of backbone geometry.
Proteins
; 51(4): 504-14, 2003 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-12784210