Detalhe da pesquisa
1.
DOOR 2.0: presenting operons and their functions through dynamic and integrated views.
Nucleic Acids Res
; 42(Database issue): D654-9, 2014 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24214966
2.
dbCAN: a web resource for automated carbohydrate-active enzyme annotation.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W445-51, 2012 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22645317
3.
Quartet decomposition server: a platform for analyzing phylogenetic trees.
BMC Bioinformatics
; 13: 123, 2012 Jun 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22676320
4.
Genome-wide discovery of missing genes in biological pathways of prokaryotes.
BMC Bioinformatics
; 12 Suppl 1: S1, 2011 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21342538
5.
DOOR: a database for prokaryotic operons.
Nucleic Acids Res
; 37(Database issue): D459-63, 2009 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18988623
6.
Metabolic Reprogramming in Cancer Is Induced to Increase Proton Production.
Cancer Res
; 80(5): 1143-1155, 2020 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31932456
7.
Hierarchical classification of functionally equivalent genes in prokaryotes.
Nucleic Acids Res
; 35(7): 2125-40, 2007.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-17353185
8.
On application of directons to functional classification of genes in prokaryotes.
Comput Biol Chem
; 32(3): 176-84, 2008 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18440870
9.
Detecting uber-operons in prokaryotic genomes.
Nucleic Acids Res
; 34(8): 2418-27, 2006.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16682449
10.
Computational inference and experimental validation of the nitrogen assimilation regulatory network in cyanobacterium Synechococcus sp. WH 8102.
Nucleic Acids Res
; 34(3): 1050-65, 2006.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16473855
11.
Comparative genomics analysis of NtcA regulons in cyanobacteria: regulation of nitrogen assimilation and its coupling to photosynthesis.
Nucleic Acids Res
; 33(16): 5156-71, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16157864
12.
Prediction of functional modules based on comparative genome analysis and Gene Ontology application.
Nucleic Acids Res
; 33(9): 2822-37, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15901854
13.
Quantitative evaluation of protein-DNA interactions using an optimized knowledge-based potential.
Nucleic Acids Res
; 33(2): 546-58, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-15673715
14.
Prediction of functional modules based on gene distributions in microbial genomes.
Genome Inform
; 16(2): 247-59, 2005.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16901107
15.
AST: an automated sequence-sampling method for improving the taxonomic diversity of gene phylogenetic trees.
PLoS One
; 9(6): e98844, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24892935
16.
Barcode server: a visualization-based genome analysis system.
PLoS One
; 8(2): e56726, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23457606
17.
Elucidation of how cancer cells avoid acidosis through comparative transcriptomic data analysis.
PLoS One
; 8(8): e71177, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23967163
18.
Tracing evolutionary footprints to identify novel gene functional linkages.
PLoS One
; 8(6): e66817, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23825567
19.
Parallel clustering algorithm for large data sets with applications in bioinformatics.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 6(2): 344-52, 2009.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19407357
20.
Mapping of orthologous genes in the context of biological pathways: An application of integer programming.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 103(1): 129-34, 2006 Jan 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-16373500