Detalhe da pesquisa
1.
Pathway Tools version 23.0 update: software for pathway/genome informatics and systems biology.
Brief Bioinform
; 22(1): 109-126, 2021 01 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31813964
2.
The MetaCyc database of metabolic pathways and enzymes - a 2019 update.
Nucleic Acids Res
; 48(D1): D445-D453, 2020 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31586394
3.
Pathway size matters: the influence of pathway granularity on over-representation (enrichment analysis) statistics.
BMC Genomics
; 22(1): 191, 2021 Mar 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33726670
4.
The BioCyc collection of microbial genomes and metabolic pathways.
Brief Bioinform
; 20(4): 1085-1093, 2019 07 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29447345
5.
Taxonomic weighting improves the accuracy of a gap-filling algorithm for metabolic models.
Bioinformatics
; 36(6): 1823-1830, 2020 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31688932
6.
The MetaCyc database of metabolic pathways and enzymes.
Nucleic Acids Res
; 46(D1): D633-D639, 2018 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29059334
7.
Finding our way through phenotypes.
PLoS Biol
; 13(1): e1002033, 2015 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25562316
8.
Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(41): 12764-9, 2015 Oct 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26385966
9.
Phylotastic! Making tree-of-life knowledge accessible, reusable and convenient.
BMC Bioinformatics
; 14: 158, 2013 May 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23668630
10.
Exploring power and parameter estimation of the BiSSE method for analyzing species diversification.
BMC Evol Biol
; 13: 38, 2013 Feb 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23398853
11.
NeXML: rich, extensible, and verifiable representation of comparative data and metadata.
Syst Biol
; 61(4): 675-89, 2012 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22357728
12.
The EcoCyc Database (2023).
EcoSal Plus
; 11(1): eesp00022023, 2023 Dec 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37220074
13.
The teleost anatomy ontology: anatomical representation for the genomics age.
Syst Biol
; 59(4): 369-83, 2010 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20547776
14.
The EcoCyc Database in 2021.
Front Microbiol
; 12: 711077, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34394059
15.
Using Pathway Covering to Explore Connections among Metabolites.
Metabolites
; 9(5)2019 May 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31052521
17.
Emerging semantics to link phenotype and environment.
PeerJ
; 3: e1470, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26713234
18.
Robots aren't the only physical models.
Behav Brain Sci
; 24(6): 1069-1070, 2001 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18241381
19.
Patterns in root traits of woody species hosting arbuscular and ectomycorrhizas: implications for the evolution of belowground strategies.
Ecol Evol
; 4(15): 2979-90, 2014 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25247056
20.
The vertebrate taxonomy ontology: a framework for reasoning across model organism and species phenotypes.
J Biomed Semantics
; 4(1): 34, 2013 Nov 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24267744