RESUMO
Klebsiella pneumoniae is considered one of the most important Gram-negative opportunistic pathogens. The contact between humans and birds poses health risks to both. The aim of this study was to investigate the resistance and virulence of K. pneumoniae isolates from psittacines and passerines, seized from illegal trade in Brazil. We analysed 32 strains isolated from birds of the orders Psittaciformes and Passeriformes by polymerase chain reaction (PCR) for virulence factor genes. Antibiotic resistance was assessed by disk diffusion assay and PCR. The results indicated that fimH (100%), uge (96.8%), kfu (81.2%) and irp-2 (68.7%) were the most common virulence genes, followed by kpn (46.8%), K2 (43.7%), mrkD (34.3%) and iroN (15.6%). The combination of virulence genes resulted in a great diversity of genotypes and the heterogeneity of the strains is also confirmed in the analysis by amplified fragment length polymorphism. The susceptibility profiles of the K. pneumoniae showed 25% of multiple antibiotic resistance strains. We identified seven strains that presented non-extended spectrum beta lactamase blaSHV variants SHV-1 and SHV-11 and one strain positive to the blaTEM-1 gene. Plasmid-mediated quinolone resistance was present in 10 strains (10/32). The data obtained in this study reveal the pathogenic potential of this pathogen and highlight the need for surveillance and monitoring.
Assuntos
Farmacorresistência Bacteriana , Klebsiella pneumoniae/patogenicidade , Passeriformes/microbiologia , Psittaciformes/microbiologia , Fatores de Virulência/genética , beta-Lactamases/genética , Animais , Anti-Infecciosos/farmacologia , Proteínas de Bactérias/genética , Brasil , Variação Genética , Genótipo , Humanos , Klebsiella pneumoniae/efeitos dos fármacos , Klebsiella pneumoniae/genética , Plasmídeos/genética , Quinolonas/farmacologia , VirulênciaRESUMO
Diseases caused by avian paramyxovirus (APMV) occur in commercial, captive and wild birds worldwide, demonstrating the significant economic and ecological importance of these agents. Paramyxoviruses belong to the paramyxoviridae family, paramyxovirinae subfamily and avulavirus genus. During the period 2000 to 2011, stool and small intestine samples of 1647 birds species were sent to the Laboratory of Electron Microscopy, Biological Institute of São Paulo, Brazil, for diagnosis of viral agents. The samples were processed by negative staining (rapid preparation) and resin embedding techniques. Under the transmission electron microscope by negative staining technique, in 294 (17.8 percent) samples of 1647 were visualized paramyxovirus particles pleomorphic, roughly spherical or filamentous, measuring 100 to 500 nm of diameter containing an envelope covered with spikes and characteristic helical herring-bone-like nucleocapsid measuring 15 to 20 nm in diameter. Ultrathin sections of the small intestine fragments revealed the presence of amorphous granular intracytoplasmic inclusions surrounded by membrane and containing viral nucleocapsid measuring 10-14 nm in diameter. Immature particles budding from cell membranes, pleomorphic, spherical and tubular particles containing viral nucleocapsid strands, and the complete particles measured up to 170 nm in diameter were seen in the cytoplasm. Intranuclear inclusions containing viral nucleocapsid were also visualized. Nuclei showed a marginalized chromatin.
Las enfermedades causadas por paramixovirus (APMV) ocurren mundialmente, tanto en aves de corral, en aquellas en vida libre o en cautiverio, lo que demuestra la importancia económica y ecológica de estos virus. El paramixovirus aviario pertenece a la familia paramyxoviridae, subfamilia paramyxovirinae y género avulavirus. Durante el periodo de 2000 a 2011, muestras de heces y fragmentos del intestino delgado de 1647 especies de aves han sido enviados al Laboratorio de Microscopía Electrónica, Instituto Biológico de São Paulo, para el diagnóstico de agentes virales. Las heces y fragmentos del intestino delgado, se procesaron por las técnicas de contraste negativo (preparación rápida) y la inclusión en resina. Al microscopio electrónico de transmisión mediante la técnica de contraste negativo se visualizaron en muestras de 294 aves, partículas de paramixovirus, pleomórficas, más o menos esféricas o filamentosas, de 100 a 500 nm de diámetro que contenían un sobre cubierto por púas que presentaban característica helicoidal, con nucleocapside tipo espiga, midiendo de 15 a 20 nm de diámetro. Secciones ultrafinas de los fragmentos del intestino delgado, revelaron en el citoplasma la presencia de inclusiones granulares amorfas rodeadas por una membrana, contiendo nucleocapside viral midiendo de 10-14 nm de diámetro, partículas inmaduras brotando de las membranas celulares, partículas virales tubulares, esféricas o pleomórficas que contenían filamentos nucleocapside. Estas partículas completas alcanzaban a los 170 nm de diámetro. Fueron observadas también, inclusiones intranucleares contiendo nucleocapside viral. Los núcleos mostraron una cromatina marginal.
Assuntos
Animais , Aves/virologia , Infecções por Avulavirus/diagnóstico , Microscopia Eletrônica de Transmissão , Paramyxoviridae/isolamento & purificaçãoRESUMO
Circovirus are viral agents that cause disease in avian species. The main clinical symptoms of the disease are immunosuppression and, in young birds feather disorders. In neonates, the disease is known as "black spot" and characterized by abdominal enlargement, hepatobiliar congestion and failure to thrive. Also, it wasobserved in adult infected birds with other symptoms and clinical signs, such as enteritis, sinusitis, rhinitis, tracheitis, bronchopneumonia, myocarditis, nephritis, splenitis, dyspnea, anorexia, depression leading to high mortality. In April 2008, 317 saffron finch were apprehended during an illegal commercialization and were forwarded to the Wild Animals Recovery Center of the Tiete Ecological Park. Subsequently, 101 (31.66 percent) died and 20 of these were selected and sent to the Laboratory of Electron Microscopy, Biological Institute of São Paulo, Brazil to investigate possible etiological agents. After necropsy of these animals fragments of lung, liver and small intestine were processed using negative staining and resin embedding techniques. On the transmission electron microscopy, the negative staining technique allowed observation in 20 (100 percent) samples of liver suspension, a great number of particles with morphology similar to the circovirus, spherical, non-enveloped, isometric, characterized as "complete" and "empty ", measuring between 17 and 20 nm in diameter. By the resin embedding technique, oval or rounded viral intracytoplasmatic inclusion bodies, containing viral particles disposed in paracrystalline arrays or loose arrangements were observed in ultrathin sections on the 20 (100 percent) samples of liver suspension. This is the first report on the presence of circovirus in saffron finch (Sicalis flaveola spp.).
Circovirus son agentes virales que causan enfermedad en las aves. Los principales síntomas clínicos de la enfermedad son la inmunosupresión y desórdenes en las plumas de aves jóvenes. En los recién nacidos la enfermedad se conoce como "punto negro" y se caracteriza por distensión abdominal, congestión hepatobiliar y falla en el desarrollo. También se han observado en las aves adultas infectadas, otros síntomas y signos clínicos, tales como la enteritis, sinusitis, rinitis, traqueitis, bronconeumonía, miocarditis, nefritis, esplenitis, disnea, anorexia, depresión llevando también a alta mortalidad. En abril de 2008, durante una comercialización ilegal, fueron confiscados 317 canarios venezolanos, siendo llevados al Centro de Rehabilitación de Animales Silvestres del Parque Ecológico de Tietê. Posteriormente, 101 (31,66 por ciento) aves murieron y entre éstas fueron seleccionadas 20 y enviadas al Laboratorio de Microscopía Electrónica, Instituto Biológico de São Paulo, para identificar el posible agente etiológico. Después de la necropsia, fragmentos de pulmón, hígado e intestino delgado se procesaron mediante las técnicas de tinción negativa y de inclusión en resina. A través de microscopía electrónica de transmisión, la técnica de tinción negativa permitió visualizar en las 20 muestras (100 por ciento) de suspensión del hígado, un gran número de partículas con morfología similar al circovirus, esférico, sin envoltura, isométrico, que se caracteriza como "completa" y "vacío", que miden entre 17 y 20 nm de diámetro. Mediante la técnica de cuerpos de inclusión en resina se observó en el 100 por ciento de las muestras de suspensión de hígado, cuerpos de inclusión virales intracitoplasmáticos, redondeadas u ovales, con partículas de virus dispuestos en matrices paracristalinas o sueltas en los cortes ultrafinos. Este es el primer reporte de la presencia de circovirus en canarios Venezolanos (Sicalis flaveola spp.).
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Animais , Canários , Circovirus/ultraestrutura , Fígado/virologia , Microscopia Eletrônica de TransmissãoRESUMO
The barn-owl (Tyto Alba) and striped-owl (Rhinoptynx clamator) belong respectively to the families Tytonidae and Strigidae. Avian paramyxoviruses have been isolated from a variety of species of wild and domestic birds wordlwide causing diverse clinical symptoms and signs. Paramyxoviruses belong to the family Paramyxoviridae and Avulovirus genus, including nine serotypes (APMV 1 to 9). The lymphoid leukosis is a retrovirus-induced neoplasia. The avian retroviruses belong to the Retroviridae family and to the Alpharetrovirus genus. Coronaviruses can cause respiratory and enteric disease in several species of birds. They belong to the Coronaviridae family and to the groups 3a e 3c. In this study, we describe the presence of viruses in four owls, two barn owls (Tyto alba) and two striped owls (Rhinoptynx clamator), rescued from tree-lined streets of Sao Paulo, Brazil and sent to the Recovery Center of Wild Animals of the Tietê Ecological Park, where the animals died. Fragments of lung, liver and small intestine of these birds were processed for transmission electron microscopy utilizing negative staining (rapid preparation), immunoelectron microscopy and immunocitochemistry techniques. Under the transmission electron microscopy paramyxovirus particles, pleomorphic, roughly spherical or filamentous, measuring 100 to 500 nm of diameter containing an envelope covered by spikes, an herring-bone helical nucleocapsid-like structure, measuring 15 to 20 nm in diameter, were visualized in the samples of lung, liver and small intestine of all owls. In small intestine samples of the two striped-owl (owls 3 and 4) it was detected pleomorphic coronavirus particles with a diameter of 75-160 nm containing a solar corona-shaped envelope, with projections of approximately 20 nm of diameter. In liver fragments of one striped-owl (owl 4) pleomorphic particles of retrovirus with a diameter of 80-145 nm containing an envelope with short projections and diameter of 9 nm were....
La lechuza (Tyto Alba) y el búho de orejas (Rhinoptynx clamator) pertenecen respectivamente a las familias Strigidae y Tytonidae. El paramixovirus aviario se ha aislado de especies de vida silveste como las aves domésticas por todo el mundo, causando diversos síntomas clínicos. El paramixovirus pertenece a la familia Paramyxoviridae y al Avulovirus genus que incluye nueve serotipos (APMV 1 a 9). La leucosis linfoide es una neoplasia inducida por retrovirus. Los retrovirus aviarios pertenecen a la familia Retroviridae y el género Alpharetrovirus. Los coronavirus pueden causar enfermedades respiratorias y entéricas en varias especies de aves. Ellos pertenecen a la familia Coronaviridae y a los grupos 3a y 3c. En este estudio, se describe la presencia del virus en cuatro búhos, dos lechuzas (Tyto alba) y dos búhos de orejas (Rhinoptynx clamator), rescatados de las calles arboladas de São Paulo, Brasil y enviados al Centro de Recuperación de Animales Silvestres del Parque Ecológico de Tietê, donde hubo murieron los animales. Fragmentos de pulmón, delhígado y del intestino delgado de estas aves fueron procesados para microscopía electrónica de transmisión utilizando tinción negativa (preparación rápida), inmunomicroscopía y técnicas de inmunocitoquímica. Bajo microscopía electrónica de transmisión, partículas de paramixovirus, pleomórficas, aproximadamente esféricas o filamentosas, de 100 a 500 nm de diámetro con un sobre cubierto por espigas, y nucleocápside helicoidal con características de espiga, midiendo 15 a 20 nm de diámetro, fueron visualizadas en las muestras de pulmón, hígado e intestino delgado de todos los búhos. En muestras de intestino delgado de dos búho de orejas (búhos 3 y 4) se detectaron partículas pleomórficas con coronavirus de un diámetro de 75-160 nm con un sobre con forma de corona solar, con proyecciones de aproximadamente 20 nm de diámetro. En el hígado de un búho de orejas (búho 4) se observaron partículas pleomórficas de retrovirus con ...
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Animais , Estrigiformes/anatomia & histologia , Estrigiformes/virologia , Vírus de RNA/imunologia , Vírus de RNA/ultraestrutura , Brasil , Coronavirus/imunologia , Coronavirus/ultraestrutura , Imuno-Histoquímica , Microscopia Eletrônica de Transmissão , Paramyxoviridae/imunologia , Paramyxoviridae/ultraestrutura , Retroviridae/imunologia , Retroviridae/ultraestruturaRESUMO
Avianpox is a highly contagious disease infecting both commercial and wild birds, causing great damages to breeders and breeding. Caused by DNA viruses of the family Poxviridae, genus Avipoxvirus, if manifest through 3 forms, cutaneous, diphtheric and septicemic. In June 2003, during illegal commercialization of Brazilian birds, 800 wild birds (Paroaria dominicana, Sporophila caerulescens and Sporophila albogularis) were apprehended and being forwarded to the CRAS (Wild Animals Recovery Center), Tietê Ecological Park. After one month, birds presented cutaneous lesions in the beak and feet and anorexia, emaciation, locomotion difficulties, diarrhea, dehydration and death. Among the 800 birds, 500 died and 40 these (15 Paroaria dominicana, 15 Sporophila caerulescens and 10 Sporophila albogularis) were sent to the Electron Microscopy Laboratory of the Biology Institute of São Paulo, SP, to investigate viral agents. Scabs and fragments of skin lesions collected of theses birds were processed for transmission electron microscopy utilizing negative staining (rapid preparation), resin embedding and immunocitochemistry techniques. Under the transmission electron microscopy in all the analyzed samples it was visualized two types of poxvirus particles, M form, with regular spaced thread-like ridges comprising the exposed surface, measuring 280 x 230 nm; C form or stain-penetrated particle showing the dumbbell-shaped core surrounded by the outer envelope, measuring 360 x 330 nm. In the ultrathin sections obtained, three types of intracytoplasmic inclusion bodies were encountered: type A or Bollinger body, outlined by membrane, containing in its interior a great number of mature particles, measuring 200 x 300 nm, revealing the inner dumbbell-shaped core, two lateral bodies and an external envelope. In the type B electron dense inclusions bodies, viral particles budding of dense amorphous material were observed. Fibrillar inclusions constituted by ...
Avianpox es una enfermedad altamente contagiosa que infecta tanto aves comerciales como aves silvestres, causando grandes daños a lo ganadería y a la crianza. Causados por los virus de ADN de la familia Poxviridae, género Avipoxvirus, se manifiestan a través de 3 formas, cutánea, diftérica y septicémica. En junio del 2003, durante la comercialización ilegal de aves brasileñas, 800 aves silvestres (Paroaria dominicana; Sporophila caerulescens; Sporophila albogularis) fueron capturadas y remitidas al CRAS (Centro de Recuperación de Animales Silvestres), Parque Ecológico de Tietê. Después de un mes, las aves presentaron lesiones cutáneas en el pico y las patas, anorexia, adelgazamiento, dificultades de locomoción, diarrea, deshidratación y muerte. 500 de las 800 aves murieron, 40 de éstas (15 Paroaria dominicana, 15 Sporophila caerulescens y 10 Sporophila albogularis) fueron enviadas al Laboratorio de Microscopía Electrónica del Instituto de Biología de São Paulo, SP, para investigar agentes virales. Costras y fragmentos de lesiones en la piel de estas aves fueron recolectadas y se procesaron para microscopía electrónica de transmisión utilizando tinción negativa (preparación rápida), incrustación de resina y técnica inmunocitoquímica. Bajo la microscopía electrónica de transmisión en todas las muestras analizadas se encontraron dos tipos de partículas de poxvirus, Forma M, con espacios regulares como hilo que abarcan toda la superficie expuesta, midiendo 280 x 230 nm; Forma C o partícula teñida por penetración mostrando núcleo en forma de pesa rodeado por una envoltura externa, que medía 360 x 330 nm. Se encontraron en secciones ultrafinas, tres tipos de cuerpos de inclusión intracitoplásmica: el tipo A o cuerpo de Bollinger, esbozado por la membrana, que contiene en su interior un gran número de partículas maduras, que miden 200 x 300 nm, revelando núcleo interno en forma de pesa, dos cuerpos laterales y una envoltura externa. En el tipo ...
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Masculino , Animais , Cabeça do Fêmur/anatomia & histologia , Cabeça do Fêmur/inervação , Cabeça do Fêmur/lesões , Cabeça do Fêmur/ultraestrutura , Galinhas/anatomia & histologia , Galinhas/crescimento & desenvolvimento , Cartilagem/anatomia & histologia , Cartilagem/lesões , Necrose da Cabeça do Fêmur/veterináriaRESUMO
Torque Teno virus (TTV) is an infectious agent of worldwide distribution isolated by the first time as the agent of an acute post-transfusion hepatitis in a patient in Japan. It has been classified into a new floating genus called Anellovirus. Recent studies showed that TTV can also be identified in serum specimens obtained from domesticated farm animals and from non-human primates. To better understand the relationship between TTV and their hosts, a study to detect virus in the serum and whole blood of Brazilian non-human primates and in the plasm of chickens was performed by applying the PCR-UTR-A technique, followed by a genomic sequence and phylogenetic analysis. By nested-PCR-UTR, the DNA of TTV was detected in sera from 4 (5.3 percent) of 75 Cebus apella, 2 (40 percent) of 5 Alouatafusca, 1 (20 percent) of 5 Alouata caraya, 1 (5.2 percent) of 19 Callithrixpenicilata, 1 (4 percent) of 25 Callithrixjacchus, 1 (20 percent) of 5 Saimiri sciureus and 1 (25 percent) of 4 Leontopithecus chrysomelas. Phylogenetic analysis revealed that sequences detected in 8 samples clustered with TTV sequences So-TTV2 (Sagüínus oedipus) and At-TTV3 (Aotes Trivirgatus). Three sequences showed similarity with a human Torque Teno Minivirus (TLMV). TTV ORF2 DNA was detected in one sera sample and one whole blood sample of non-human primates and in one plasm sample of chicken. Phylogenetic analysis revealed that the sequences amplified by the ORF2 region show no difference between human, non-human primates and chicken. This is the first report of TTV in Brazilian new world non-human primates and chicken.
Torque Teno virus (TTV) es una agente infeccioso de distribución mundial, aislado por primera vez como el agente de una hepatitis aguda posterior a la transfusión de un paciente en Japón. Se ha clasificado en un nuevo género flotante llamado Anellovirus. Recientes estudios han demostrado que TTV también puede ser identificado en el suero de especímenes obtenidos desde granjas de animales domésticos y desde primates no humanos. Para entender mejor la relación entre la TTV y sus huéspedes, fue realizado un estudio para detectar el virus en el suero y la sangre de primates no humanos brasileños y en el plasma de pollos mediante la aplicación de la técnica PCR-UTR-A, seguida de una secuencia genómica y análisis filogenético. Por medio de PCR-UTR-anidado, el ADN de TTV fue detectado en sueros de 4 de 75 (5,3 por ciento)Cebus apella, 2 de 5 (40 por ciento) Alouata fusca, 1 de 5 (20 por ciento) de Alouata caraya, 1 de 19 (5,2 por ciento) de Callithrixpenicilata, 1 de 25 (4 por ciento) Callithrixjacchus, 1 de 5 (20 por ciento) de Saimiri sciureus y 1 de 4 (25 por ciento) de Leontopithecus chrysomelas. El análisis filogenético reveló secuencias detectadas en 8 muestras agrupadas con TTV secuencias So-TTV2 (Sagüínus oedipus) y At-TTV3 (Aotes Trivirgatus). Tres secuencias mostraron similitud con el Torque Teno Minivirus humano (TLMV). Fue detectado TTV ORF2 ADN en una muestra de suero y una muestra de sangre de primates no-humanos y en una muestra de plasma de pollo. El análisis filogenético reveló que las secuencias amplificadas por la región ORF2 no muestran ninguna diferencia entre humanos, primates no humanos y pollos. Este es el primer informe de nuevos TTV en primates-no humanos brasileños y en pollos.
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Animais , Doenças das Aves Domésticas/virologia , Doenças dos Primatas/virologia , Infecções por Vírus de DNA/genética , Infecções por Vírus de DNA/veterinária , Torque teno virus/isolamento & purificação , DNA Viral/genética , Sequência de Aminoácidos , Brasil , Doenças das Aves Domésticas/genética , Doenças dos Primatas/genética , Genoma Viral , Infecções por Vírus de DNA/virologia , Filogenia , Reação em Cadeia da Polimerase , Galinhas/virologia , Primatas/virologia , Análise de Sequência de DNA , Torque teno virus/genética , Regiões não TraduzidasRESUMO
Torque teno virus (TTV) is a recently discovered DNA virus that was originally isolated from a Japanese patient (initials, TT) with post-transfusion hepatitis of unknown aetiology. TTV is an circular DNA virus classified recently together with related Torque teño minivirus, into a new genus called Anellovirus. Infection TTV has been detected in a range of non-human primates as well as domestic animals. The purpose of this study was to search TTV in the serum and total blood of Brazilian monkeys and in plasma of domestic chickens by seminested PCR of coding region (N22), followed by a genomic sequence and phylogenetic analysis. No serum sample was amplified. TTV DNA was detected in total blood from 3 (4 percent) out of 75 brown-capuchin (Cebus apella) and from 1 (25 percent) out of 4 golden-headed lion-tamarin (Leontopithecus chrysomelas). Phylogenetic analysis revealed that one sample showed similarity with one sequence of the cotton top tamarin (Saguinus oedipus) (So-TTV2) and with one of the douroucoulis (ão tes trivirgatus) (At-TTV3). Two samples showed similarity with a human Torque Teño Mini Virus (TLMV). The other sample clustered with one sequence of the chimpanzee (Pt-TTV6) and with the human TTV strain TA278. The plasma chicken samples tested were all negative. The amino acid sequences reported in this study are the first obtained in Brazil from total blood of non-human primates naturally infected by TTV.
Torque teno virus (TTV) es un virus de ADN recientemente descubierto que fue inicialmente aislado de un paciente japonés (iniciales TT) después de la transfusión de hepatitis de etiología desconocida. TTV es un virus de ADN circular recientemente clasificado junto con los torque teno minivirus, en un nuevo género llamado Anellovirus. La infección de TTV se ha detectado en una serie de primates no humanos, así como animales domésticos. El objetivo de este estudio fue buscar TTV en el suero y sangre total de monos de Brasil y en el plasma de pollos domésticos, por seminested PCR de la región de codificación (N22), seguido de una secuencia genómica y el análisis filogenético. Las muestras que no eran suero fueron amplificadas. TTV DNA se detectó en sangre total de 3 (4 por ciento) de un total de 75 capuchinos de cabeza dura (Cebus apella) y de 1 (25 por ciento) de un total de 4 tití- león de cabeza dorada (Leontopithecus chrysomelas). El análisis filogenético demostró que una muestra presentaba similitud con una secuencia de Saguinus Edipo (So-TTV2) y con una de Aotes trivirgatus (A-TTV3). Dos muestras mostraron similitud con un torque teno mini virus (TLMV) humano. La otra muestra agrupada con una secuencia de los chimpancés (PT-TTV6) y con el TTV humanos cepa TA278. El análisis de las muestras de plasma de pollo fueron negativas Las secuencias de aminoácidos que se reportan en este estudio son las primeras obtenidas en Brasil de sangre de primates no humanos infectados naturalmente por TTV.