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1.
Nat Genet ; 49(7): 993-1004, 2017 07.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28553957

RESUMO

Exfoliation syndrome (XFS) is the most common known risk factor for secondary glaucoma and a major cause of blindness worldwide. Variants in two genes, LOXL1 and CACNA1A, have previously been associated with XFS. To further elucidate the genetic basis of XFS, we collected a global sample of XFS cases to refine the association at LOXL1, which previously showed inconsistent results across populations, and to identify new variants associated with XFS. We identified a rare protective allele at LOXL1 (p.Phe407, odds ratio (OR) = 25, P = 2.9 × 10-14) through deep resequencing of XFS cases and controls from nine countries. A genome-wide association study (GWAS) of XFS cases and controls from 24 countries followed by replication in 18 countries identified seven genome-wide significant loci (P < 5 × 10-8). We identified association signals at 13q12 (POMP), 11q23.3 (TMEM136), 6p21 (AGPAT1), 3p24 (RBMS3) and 5q23 (near SEMA6A). These findings provide biological insights into the pathology of XFS and highlight a potential role for naturally occurring rare LOXL1 variants in disease biology.


Assuntos
Aminoácido Oxirredutases/genética , Síndrome de Exfoliação/genética , Estudo de Associação Genômica Ampla , Mutação de Sentido Incorreto , Mutação Puntual , Idoso de 80 Anos ou mais , Alelos , Aminoácido Oxirredutases/fisiologia , Substituição de Aminoácidos , Povo Asiático/genética , Canais de Cálcio/genética , Adesão Celular , Síndrome de Exfoliação/etnologia , Matriz Extracelular/metabolismo , Olho/metabolismo , Feminino , Perfilação da Expressão Gênica , Predisposição Genética para Doença , Haplótipos , Humanos , Masculino , Chaperonas Moleculares/biossíntese , Chaperonas Moleculares/genética , RNA Mensageiro/biossíntese , Esferoides Celulares
2.
Nat Genet ; 47(4): 387-92, 2015 Apr.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-25706626

RESUMO

Exfoliation syndrome (XFS) is the most common recognizable cause of open-angle glaucoma worldwide. To better understand the etiology of XFS, we conducted a genome-wide association study (GWAS) of 1,484 cases and 1,188 controls from Japan and followed up the most significant findings in a further 6,901 cases and 20,727 controls from 17 countries across 6 continents. We discovered a genome-wide significant association between a new locus (CACNA1A rs4926244) and increased susceptibility to XFS (odds ratio (OR) = 1.16, P = 3.36 × 10(-11)). Although we also confirmed overwhelming association at the LOXL1 locus, the key SNP marker (LOXL1 rs4886776) demonstrated allelic reversal depending on the ancestry group (Japanese: OR(A allele) = 9.87, P = 2.13 × 10(-217); non-Japanese: OR(A allele) = 0.49, P = 2.35 × 10(-31)). Our findings represent the first genetic locus outside of LOXL1 surpassing genome-wide significance for XFS and provide insight into the biology and pathogenesis of the disease.


Assuntos
Canais de Cálcio/genética , Síndrome de Exfoliação/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Animais , Povo Asiático/genética , Povo Asiático/estatística & dados numéricos , Estudos de Casos e Controles , Mapeamento Cromossômico , Síndrome de Exfoliação/epidemiologia , Predisposição Genética para Doença , Estudo de Associação Genômica Ampla , Glaucoma de Ângulo Aberto/epidemiologia , Glaucoma de Ângulo Aberto/genética , Células HEK293 , Células HeLa , Humanos , Japão/epidemiologia , Células MCF-7 , Camundongos , Camundongos Endogâmicos C57BL , Células Tumorais Cultivadas
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