Detalhe da pesquisa
1.
A Genome-wide Framework for Mapping Gene Regulation via Cellular Genetic Screens.
Cell
; 176(1-2): 377-390.e19, 2019 01 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30612741
2.
Spatial and temporal organization of the genome: Current state and future aims of the 4D nucleome project.
Mol Cell
; 83(15): 2624-2640, 2023 08 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37419111
3.
A Genome-wide Framework for Mapping Gene Regulation via Cellular Genetic Screens.
Cell
; 176(6): 1516, 2019 Mar 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30849375
4.
Navigating the pitfalls of applying machine learning in genomics.
Nat Rev Genet
; 23(3): 169-181, 2022 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34837041
5.
A High-Throughput Screen for Transcription Activation Domains Reveals Their Sequence Features and Permits Prediction by Deep Learning.
Mol Cell
; 78(5): 890-902.e6, 2020 06 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32416068
6.
High-Throughput Single-Cell Sequencing with Linear Amplification.
Mol Cell
; 76(4): 676-690.e10, 2019 11 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31495564
7.
Expanded encyclopaedias of DNA elements in the human and mouse genomes.
Nature
; 583(7818): 699-710, 2020 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32728249
8.
Analysis of Tandem Mass Spectrometry Data with CONGA: Combining Open and Narrow Searches with Group-Wise Analysis.
J Proteome Res
; 2024 Apr 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38652578
9.
Inference of 3D genome architecture by modeling overdispersion of Hi-C data.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36594573
10.
Bridging the False Discovery Gap.
J Proteome Res
; 22(7): 2172-2178, 2023 07 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37261867
11.
Evaluating Proteomics Imputation Methods with Improved Criteria.
J Proteome Res
; 22(11): 3427-3438, 2023 11 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37861703
12.
Author Correction: Expanded encyclopaedias of DNA elements in the human and mouse genomes.
Nature
; 605(7909): E3, 2022 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35474001
13.
A High-Throughput Screen for Transcription Activation Domains Reveals Their Sequence Features and Permits Prediction by Deep Learning.
Mol Cell
; 79(6): 1066, 2020 09 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32946759
14.
Building Spectral Libraries from Narrow-Window Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry Data.
J Proteome Res
; 21(6): 1382-1391, 2022 06 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35549345
15.
ppx: Programmatic Access to Proteomics Data Repositories.
J Proteome Res
; 20(9): 4621-4624, 2021 09 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34342226
16.
mokapot: Fast and Flexible Semisupervised Learning for Peptide Detection.
J Proteome Res
; 20(4): 1966-1971, 2021 04 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33596079
17.
Accurately Assigning Peptides to Spectra When Only a Subset of Peptides Are Relevant.
J Proteome Res
; 20(8): 4153-4164, 2021 08 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34236864
18.
Subzero, saline incubations of Colwellia psychrerythraea reveal strategies and biomarkers for sustained life in extreme icy environments.
Environ Microbiol
; 23(7): 3840-3866, 2021 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33760340
19.
Sci-Hi-C: A single-cell Hi-C method for mapping 3D genome organization in large number of single cells.
Methods
; 170: 61-68, 2020 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31536770
20.
Machine Learning Strategy That Leverages Large Data sets to Boost Statistical Power in Small-Scale Experiments.
J Proteome Res
; 19(3): 1267-1274, 2020 03 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32009418