Detalhe da pesquisa
1.
An evolved AAV variant enables efficient genetic engineering of murine T cells.
Cell
; 186(2): 446-460.e19, 2023 01 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36638795
2.
Evolutionary Persistence of DNA Methylation for Millions of Years after Ancient Loss of a De Novo Methyltransferase.
Cell
; 180(2): 263-277.e20, 2020 01 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31955845
3.
Evolutionary Persistence of DNA Methylation for Millions of Years after Ancient Loss of a De Novo Methyltransferase.
Cell
; 180(4): 816, 2020 Feb 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32084344
4.
Genetic interactions drive heterogeneity in causal variant effect sizes for gene expression and complex traits.
Am J Hum Genet
; 109(7): 1286-1297, 2022 07 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35716666
5.
Accounting for isoform expression increases power to identify genetic regulation of gene expression.
PLoS Comput Biol
; 20(2): e1011857, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38346082
6.
Differential analysis of RNA-seq incorporating quantification uncertainty.
Nat Methods
; 14(7): 687-690, 2017 Jul.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28581496
7.
A dynamic intron retention program enriched in RNA processing genes regulates gene expression during terminal erythropoiesis.
Nucleic Acids Res
; 44(2): 838-51, 2016 Jan 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26531823
8.
The Lair: a resource for exploratory analysis of published RNA-Seq data.
BMC Bioinformatics
; 17(1): 490, 2016 Dec 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27905880
9.
A dynamic alternative splicing program regulates gene expression during terminal erythropoiesis.
Nucleic Acids Res
; 42(6): 4031-42, 2014 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24442673
10.
Rosace: a robust deep mutational scanning analysis framework employing position and mean-variance shrinkage.
Genome Biol
; 25(1): 138, 2024 May 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38789982
11.
kallisto, bustools, and kb-python for quantifying bulk, single-cell, and single-nucleus RNA-seq.
bioRxiv
; 2024 Jan 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38045414
12.
Identification of novel transcripts in annotated genomes using RNA-Seq.
Bioinformatics
; 27(17): 2325-9, 2011 Sep 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21697122
13.
Gene-level differential analysis at transcript-level resolution.
Genome Biol
; 19(1): 53, 2018 04 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29650040
14.
Intron retention is a source of neoepitopes in cancer.
Nat Biotechnol
; 36(11): 1056-1058, 2018 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30114007
15.
Zika infection of neural progenitor cells perturbs transcription in neurodevelopmental pathways.
PLoS One
; 12(4): e0175744, 2017.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28448519
16.
Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification.
Nat Biotechnol
; 34(5): 525-7, 2016 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27043002
17.
TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions.
Genome Biol
; 14(4): R36, 2013 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23618408
18.
Differential gene and transcript expression analysis of RNA-seq experiments with TopHat and Cufflinks.
Nat Protoc
; 7(3): 562-78, 2012 Mar 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22383036
19.
Erratum: Near-optimal probabilistic RNA-seq quantification.
Nat Biotechnol
; 34(8): 888, 2016 08 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27504780