Detalhe da pesquisa
1.
A review on viral data sources and search systems for perspective mitigation of COVID-19.
Brief Bioinform
; 22(2): 664-675, 2021 03 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33348368
2.
Federated sharing and processing of genomic datasets for tertiary data analysis.
Brief Bioinform
; 22(3)2021 05 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34020536
3.
ViruClust: direct comparison of SARS-CoV-2 genomes and genetic variants in space and time.
Bioinformatics
; 38(7): 1988-1994, 2022 03 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35040923
4.
ViruSurf: an integrated database to investigate viral sequences.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D817-D824, 2021 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33045721
5.
VirusViz: comparative analysis and effective visualization of viral nucleotide and amino acid variants.
Nucleic Acids Res
; 49(15): e90, 2021 09 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34107016
6.
Identifying collateral and synthetic lethal vulnerabilities within the DNA-damage response.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 250, 2021 May 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33992077
7.
Processing of big heterogeneous genomic datasets for tertiary analysis of Next Generation Sequencing data.
Bioinformatics
; 35(5): 729-736, 2019 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30101316
8.
PyGMQL: scalable data extraction and analysis for heterogeneous genomic datasets.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 560, 2019 Nov 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31703553
9.
Modeling and interoperability of heterogeneous genomic big data for integrative processing and querying.
Methods
; 111: 3-11, 2016 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27637471
10.
GenoMetric Query Language: a novel approach to large-scale genomic data management.
Bioinformatics
; 31(12): 1881-8, 2015 Jun 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25649616
11.
Computational algorithms to predict Gene Ontology annotations.
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 6: S4, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25916950
12.
VariantHunter: a method and tool for fast detection of emerging SARS-CoV-2 variants.
Database (Oxford)
; 20232023 07 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37410916
13.
SARS-CoV-2 viremia and COVID-19 mortality: A prospective observational study.
PLoS One
; 18(4): e0281052, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37115764
14.
The ENCODE Imputation Challenge: a critical assessment of methods for cross-cell type imputation of epigenomic profiles.
Genome Biol
; 24(1): 79, 2023 04 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37072822
15.
Predicting Drug Synergism by Means of Non-Negative Matrix Tri-Factorization.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 19(4): 1956-1967, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34166199
16.
High Performance Integration Pipeline for Viral and Epitope Sequences.
BioTech (Basel)
; 11(1)2022 Mar 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35822815
17.
Analysis of co-occurring and mutually exclusive amino acid changes and detection of convergent and divergent evolution events in SARS-CoV-2.
Comput Struct Biotechnol J
; 20: 4238-4250, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35945925
18.
Investigating Deep Learning Based Breast Cancer Subtyping Using Pan-Cancer and Multi-Omic Data.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 19(1): 121-134, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33270566
19.
Whole transcriptomic analysis of mesenchymal stem cells cultured in Nichoid micro-scaffolds.
Front Bioeng Biotechnol
; 10: 945474, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36686258
20.
VirusLab: A Tool for Customized SARS-CoV-2 Data Analysis.
BioTech (Basel)
; 10(4)2021 Nov 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35822801