Detalhe da pesquisa
1.
SPLASH: A statistical, reference-free genomic algorithm unifies biological discovery.
Cell
; 186(25): 5440-5456.e26, 2023 12 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38065078
2.
OASIS: An interpretable, finite-sample valid alternative to Pearson's X2 for scientific discovery.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 121(15): e2304671121, 2024 Apr 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38564640
3.
Large-scale benchmarking of circRNA detection tools reveals large differences in sensitivity but not in precision.
Nat Methods
; 20(8): 1159-1169, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37443337
4.
The SpliZ generalizes 'percent spliced in' to reveal regulated splicing at single-cell resolution.
Nat Methods
; 19(3): 307-310, 2022 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35241832
5.
TGS1 impacts snRNA 3'-end processing, ameliorates survival motor neuron-dependent neurological phenotypes in vivo and prevents neurodegeneration.
Nucleic Acids Res
; 50(21): 12400-12424, 2022 11 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35947650
6.
Detecting circular RNAs: bioinformatic and experimental challenges.
Nat Rev Genet
; 17(11): 679-692, 2016 10 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27739534
7.
Improved detection of gene fusions by applying statistical methods reveals oncogenic RNA cancer drivers.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(31): 15524-15533, 2019 07 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31308241
8.
Publisher Correction: The SpliZ generalizes 'percent spliced in' to reveal regulated splicing at single-cell resolution.
Nat Methods
; 19(5): 628, 2022 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35468970
9.
Ambiguous splice sites distinguish circRNA and linear splicing in the human genome.
Bioinformatics
; 35(8): 1263-1268, 2019 04 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30192918
10.
Molecular sampling at logarithmic rates for next-generation sequencing.
PLoS Comput Biol
; 15(12): e1007537, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31830035
11.
ciRS-7 exonic sequence is embedded in a long non-coding RNA locus.
PLoS Genet
; 13(12): e1007114, 2017 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29236709
12.
Circular RNA Expression: Its Potential Regulation and Function.
Trends Genet
; 32(5): 309-316, 2016 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27050930
13.
Circular RNAs: analysis, expression and potential functions.
Development
; 143(11): 1838-47, 2016 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27246710
14.
Statistical algorithms improve accuracy of gene fusion detection.
Nucleic Acids Res
; 45(13): e126, 2017 Jul 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28541529
15.
Cell-type specific features of circular RNA expression.
PLoS Genet
; 9(9): e1003777, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24039610
16.
Analysis of streptococcal CRISPRs from human saliva reveals substantial sequence diversity within and between subjects over time.
Genome Res
; 21(1): 126-36, 2011 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21149389
17.
Conservation of streptococcal CRISPRs on human skin and saliva.
BMC Microbiol
; 14: 146, 2014 Jun 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24903519
18.
ESRRA-C11orf20 is a recurrent gene fusion in serous ovarian carcinoma.
PLoS Biol
; 9(9): e1001156, 2011 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21949640
19.
SPLASH2 provides ultra-efficient, scalable, and unsupervised discovery on raw sequencing reads.
bioRxiv
; 2024 Mar 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36993432
20.
Interstitial macrophages are a focus of viral takeover and inflammation in COVID-19 initiation in human lung.
J Exp Med
; 221(6)2024 Jun 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38597954