Detalhe da pesquisa
1.
Julia for biologists.
Nat Methods
; 20(5): 655-664, 2023 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37024649
2.
BondGraphs.jl: composable energy-based modelling in systems biology.
Bioinformatics
; 39(10)2023 Oct 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37725363
3.
HyperGraphs.jl: representing higher-order relationships in Julia.
Bioinformatics
; 38(14): 3660-3661, 2022 07 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35674360
4.
Collocation based training of neural ordinary differential equations.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 20(2): 37-49, 2021 07 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34237805
5.
The chemical Langevin equation for biochemical systems in dynamic environments.
J Chem Phys
; 157(9): 094105, 2022 Sep 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36075715
6.
A group theoretic approach to model comparison with simplicial representations.
J Math Biol
; 85(5): 48, 2022 10 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36209430
7.
Author Correction: Julia for biologists.
Nat Methods
; 20(5): 771, 2023 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37120675
8.
GpABC: a Julia package for approximate Bayesian computation with Gaussian process emulation.
Bioinformatics
; 36(10): 3286-3287, 2020 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32022854
9.
Noise and the molecular processes underlying cell fate decision-making.
Phys Biol
; 18(1): 011002, 2021 01 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33181489
10.
The design principles of discrete turing patterning systems.
J Theor Biol
; 531: 110901, 2021 12 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34530030
11.
Turing pattern design principles and their robustness.
Philos Trans A Math Phys Eng Sci
; 379(2213): 20200272, 2021 Dec 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34743598
12.
Proteolytic dynamics of human 20S thymoproteasome.
J Biol Chem
; 294(19): 7740-7754, 2019 05 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30914481
13.
Extrinsic Noise and Heavy-Tailed Laws in Gene Expression.
Phys Rev Lett
; 124(10): 108101, 2020 Mar 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32216388
14.
Exactly solvable models of stochastic gene expression.
J Chem Phys
; 152(14): 144106, 2020 Apr 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32295361
15.
Quantifying Dynamic Regulation in Metabolic Pathways with Nonparametric Flux Inference.
Biophys J
; 116(10): 2035-2046, 2019 05 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31076100
16.
Parametric and non-parametric gradient matching for network inference: a comparison.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 52, 2019 Jan 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30683048
17.
PEITH(Θ): perfecting experiments with information theory in Python with GPU support.
Bioinformatics
; 34(7): 1249-1250, 2018 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29228182
18.
Transition state characteristics during cell differentiation.
PLoS Comput Biol
; 14(9): e1006405, 2018 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30235202
19.
Concise Review: Stem Cell Population Biology: Insights from Hematopoiesis.
Stem Cells
; 35(1): 80-88, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27671750
20.
Single Cell Phenotyping Reveals Heterogeneity Among Hematopoietic Stem Cells Following Infection.
Stem Cells
; 35(11): 2292-2304, 2017 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28833970