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1.
Science ; 302(5646): 842-6, 2003 Oct 31.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-14593172

RESUMO

Functional analysis of a genome requires accurate gene structure information and a complete gene inventory. A dual experimental strategy was used to verify and correct the initial genome sequence annotation of the reference plant Arabidopsis. Sequencing full-length cDNAs and hybridizations using RNA populations from various tissues to a set of high-density oligonucleotide arrays spanning the entire genome allowed the accurate annotation of thousands of gene structures. We identified 5817 novel transcription units, including a substantial amount of antisense gene transcription, and 40 genes within the genetically defined centromeres. This approach resulted in completion of approximately 30% of the Arabidopsis ORFeome as a resource for global functional experimentation of the plant proteome.


Assuntos
Arabidopsis/genética , Genoma de Planta , RNA Mensageiro/genética , RNA de Plantas/genética , Transcrição Gênica , Mapeamento Cromossômico , Cromossomos de Plantas/genética , Clonagem Molecular , Biologia Computacional , DNA Complementar/genética , DNA Intergênico , Etiquetas de Sequências Expressas , Perfilação da Expressão Gênica , Genes de Plantas , Genômica , Hibridização de Ácido Nucleico , Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos , Fases de Leitura Aberta , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
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