Detalhe da pesquisa
1.
Spread of a SARS-CoV-2 variant through Europe in the summer of 2020.
Nature
; 595(7869): 707-712, 2021 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34098568
2.
Estimates of early outbreak-specific SARS-CoV-2 epidemiological parameters from genomic data.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 121(2): e2308125121, 2024 Jan 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38175864
3.
Bayesian phylodynamics reveals the transmission dynamics of avian influenza A(H7N9) virus at the human-live bird market interface in China.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 120(17): e2215610120, 2023 04 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37068240
4.
ReMASTER: improved phylodynamic simulation for BEAST 2.7.
Bioinformatics
; 40(1)2024 01 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38195927
5.
Decoding the Fundamental Drivers of Phylodynamic Inference.
Mol Biol Evol
; 40(6)2023 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37264694
6.
The origin and early spread of SARS-CoV-2 in Europe.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(9)2021 03 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33571105
7.
Joint Inference of Migration and Reassortment Patterns for Viruses with Segmented Genomes.
Mol Biol Evol
; 39(1)2022 01 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34893876
8.
TreeKnit: Inferring ancestral reassortment graphs of influenza viruses.
PLoS Comput Biol
; 18(8): e1010394, 2022 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35984845
9.
Bayesian inference of reassortment networks reveals fitness benefits of reassortment in human influenza viruses.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(29): 17104-17111, 2020 07 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32631984
10.
Novel Integrative Modeling of Molecules and Morphology across Evolutionary Timescales.
Syst Biol
; 71(1): 208-220, 2021 12 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34228807
11.
A Multitype Birth-Death Model for Bayesian Inference of Lineage-Specific Birth and Death Rates.
Syst Biol
; 69(5): 973-986, 2020 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32105322
12.
Estimating Epidemic Incidence and Prevalence from Genomic Data.
Mol Biol Evol
; 36(8): 1804-1816, 2019 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31058982
13.
BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis.
PLoS Comput Biol
; 15(4): e1006650, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30958812
14.
Taming the BEAST-A Community Teaching Material Resource for BEAST 2.
Syst Biol
; 67(1): 170-174, 2018 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28673048
15.
IcyTree: rapid browser-based visualization for phylogenetic trees and networks.
Bioinformatics
; 33(15): 2392-2394, 2017 Aug 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28407035
16.
Phylodynamics with Migration: A Computational Framework to Quantify Population Structure from Genomic Data.
Mol Biol Evol
; 33(8): 2102-16, 2016 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27189573
17.
Molecular Approaches to Understanding Transmission and Source Attribution in Nontyphoidal Salmonella and Their Application in Africa.
Clin Infect Dis
; 61 Suppl 4: S259-65, 2015 Nov 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26449940
18.
How well can the exponential-growth coalescent approximate constant-rate birth-death population dynamics?
Proc Biol Sci
; 282(1806): 20150420, 2015 May 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25876846
19.
Efficient Bayesian inference under the structured coalescent.
Bioinformatics
; 30(16): 2272-9, 2014 Aug 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24753484
20.
Genetic diversity loss in a biodiversity hotspot: ancient DNA quantifies genetic decline and former connectivity in a critically endangered marsupial.
Mol Ecol
; 24(23): 5813-28, 2015 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26497007