Detalhe da pesquisa
1.
A graphical, interactive and GPU-enabled workflow to process long-read sequencing data.
BMC Genomics
; 22(1): 626, 2021 Aug 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34425749
2.
Holistic optimization of an RNA-seq workflow for multi-threaded environments.
Bioinformatics
; 35(20): 4173-4175, 2019 10 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30859176
3.
Identifying Dynamical Time Series Model Parameters from Equilibrium Samples, with Application to Gene Regulatory Networks.
Stat Modelling
; 19(4): 444-465, 2019 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33824624
4.
Construction of regulatory networks using expression time-series data of a genotyped population.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(48): 19436-41, 2011 Nov 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22084118
5.
A Randomized Controlled Trial of Precision Nutrition Counseling for Service Members at Risk for Metabolic Syndrome.
Mil Med
; 188(Suppl 6): 606-613, 2023 11 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37948286
6.
Rapid detection of myeloid neoplasm fusions using single-molecule long-read sequencing.
PLOS Glob Public Health
; 3(9): e0002267, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37699001
7.
Cloud-enabled Biodepot workflow builder integrates image processing using Fiji with reproducible data analysis using Jupyter notebooks.
Sci Rep
; 12(1): 14920, 2022 Sep 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36056115
8.
Container Profiler: Profiling resource utilization of containerized big data pipelines.
Gigascience
; 122022 12 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37624874
9.
The derivation of diagnostic markers of chronic myeloid leukemia progression from microarray data.
Blood
; 114(15): 3292-8, 2009 Oct 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19654405
10.
Iterative Bayesian Model Averaging: a method for the application of survival analysis to high-dimensional microarray data.
BMC Bioinformatics
; 10: 72, 2009 Feb 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19245714
11.
Methods for the inference of biological pathways and networks.
Methods Mol Biol
; 541: 225-45, 2009.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19381545
12.
Integration of Multiple Data Sources for Gene Network Inference Using Genetic Perturbation Data.
J Comput Biol
; 26(10): 1113-1129, 2019 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31009236
13.
Building Containerized Workflows Using the BioDepot-Workflow-Builder.
Cell Syst
; 9(5): 508-514.e3, 2019 11 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31521606
14.
Hot-starting software containers for STAR aligner.
Gigascience
; 7(8)2018 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30085034
15.
Reproducible Bioconductor workflows using browser-based interactive notebooks and containers.
J Am Med Inform Assoc
; 25(1): 4-12, 2018 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29092073
16.
A crowdsourced analysis to identify ab initio molecular signatures predictive of susceptibility to viral infection.
Nat Commun
; 9(1): 4418, 2018 10 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30356117
17.
GUIdock-VNC: using a graphical desktop sharing system to provide a browser-based interface for containerized software.
Gigascience
; 6(4): 1-6, 2017 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28327936
18.
fastBMA: scalable network inference and transitive reduction.
Gigascience
; 6(10): 1-10, 2017 10 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29020744
19.
Model-Based Clustering With Data Correction For Removing Artifacts In Gene Expression Data.
Ann Appl Stat
; 11(4): 1998-2026, 2016 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30740193
20.
A posterior probability approach for gene regulatory network inference in genetic perturbation data.
Math Biosci Eng
; 13(6): 1241-1251, 2016 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27775378