In silico region of difference (RD) analysis of Mycobacterium tuberculosis complex from sequence reads using RD-Analyzer.

Faksri, Kiatichai; Xia, Eryu; Tan, Jun Hao; Teo, Yik-Ying; Ong, Rick Twee-Hee

Faksri, Kiatichai; Xia, Eryu; Tan, Jun Hao; Teo, Yik-Ying; Ong, Rick Twee-Hee.

Afiliación

Faksri K; Department of Microbiology Faculty of Medicine, Khon Kaen University, Khon Kaen, Thailand.
Xia E; Research and Diagnostic Center for Emerging Infectious Diseases (RCEID), Khon Kaen University, Khon Kaen, Thailand.
Tan JH; NUS Graduate School for Integrative Sciences and Engineering, National University of Singapore, Singapore, Singapore.
Teo YY; Saw Swee Hock School of Public Health, National University of Singapore, Tahir Foundation Building, 12 Science Drive 2, #10-01, Singapore, 117549, Singapore.
Ong RT; NUS Graduate School for Integrative Sciences and Engineering, National University of Singapore, Singapore, Singapore.

BMC Genomics ; 17(1): 847, 2016 11 02.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27806686

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Variación Genética; Genoma Bacteriano; Genómica/métodos; Mycobacterium tuberculosis/clasificación; Mycobacterium tuberculosis/genética; Algoritmos; Conjuntos de Datos como Asunto; Marcadores Genéticos; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Reproducibilidad de los Resultados; Flujo de Trabajo

Palabras clave

Mycobacterium tuberculosis complex; Region of difference analysis; Whole-genome sequence analysis

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Variación Genética / Genoma Bacteriano / Biología Computacional / Genómica / Mycobacterium tuberculosis Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2016 Tipo del documento: Article País de afiliación: Tailandia

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