k-SLAM: accurate and ultra-fast taxonomic classification and gene identification for large metagenomic data sets.

Ainsworth, David; Sternberg, Michael J E; Raczy, Come; Butcher, Sarah A

Ainsworth, David; Sternberg, Michael J E; Raczy, Come; Butcher, Sarah A.

Afiliación

Ainsworth D; Centre for Integrative Systems Biology and Bioinformatics, Division of Molecular Biosciences, Faculty of Natural Sciences, Imperial College London, SW7 2AZ, London, UK.
Sternberg MJE; Centre for Integrative Systems Biology and Bioinformatics, Division of Molecular Biosciences, Faculty of Natural Sciences, Imperial College London, SW7 2AZ, London, UK.
Raczy C; Illumina Inc., 5200 Illumina Way, San Diego, CA 92122, USA.
Butcher SA; Bioinformatics Data Science Group, Department of Surgery and Cancer, Faculty of Medicine, Imperial College London, SW7 2AZ, London, UK.

Nucleic Acids Res ; 45(4): 1649-1656, 2017 02 28.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-27965413

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Código de Barras del ADN Taxonómico/métodos; Metagenoma; Metagenómica/métodos; Algoritmos; Estudios de Casos y Controles; Biología Computacional/normas; Código de Barras del ADN Taxonómico/normas; Microbioma Gastrointestinal; Genoma Bacteriano; Humanos; Cirrosis Hepática/microbiología; Metagenómica/normas; Reproducibilidad de los Resultados; Escherichia coli Shiga-Toxigénica/clasificación; Escherichia coli Shiga-Toxigénica/genética

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Biología Computacional / Metagenoma / Metagenómica / Código de Barras del ADN Taxonómico Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Observational_studies / Prognostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Año: 2017 Tipo del documento: Article País de afiliación: Reino Unido

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