Metabolomics Data Preprocessing Using ADAP and MZmine 2.

Du, Xiuxia; Smirnov, Aleksandr; Pluskal, Tomás; Jia, Wei; Sumner, Susan

Du, Xiuxia; Smirnov, Aleksandr; Pluskal, Tomás; Jia, Wei; Sumner, Susan.

Afiliación

Du X; Department of Bioinformatics and Genomics, University of North Carolina at Charlotte, Charlotte, NC, USA. xiuxia.du@uncc.edu.
Smirnov A; Department of Bioinformatics and Genomics, University of North Carolina at Charlotte, Charlotte, NC, USA.
Pluskal T; Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA, USA.
Jia W; University of Hawaii Cancer Center, Honolulu, HI, USA.
Sumner S; Department of Nutrition, School of Public Health, NIH Eastern Regional Comprehensive Metabolomics Resource Core (ERCMRC), Nutrition Research Institute, University of North Carolina at Chapel Hill, Kannapolis, NC, USA.

Methods Mol Biol ; 2104: 25-48, 2020.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31953811

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Interpretación Estadística de Datos; Metabolómica; Programas Informáticos; Algoritmos; Cromatografía Liquida; Cromatografía de Gases y Espectrometría de Masas; Humanos; Espectrometría de Masas; Metabolómica/métodos; Interfaz Usuario-Computador; Flujo de Trabajo

Palabras clave

ADAP; Alignment; Data preprocessing; GCMS; LCMS; MZmine 2; Metabolomics; Peak picking; Spectral deconvolution; Visualization

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Interpretación Estadística de Datos / Biología Computacional / Metabolómica Límite: Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos

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