Improving CLIP-seq data analysis by incorporating transcript information.

Uhl, Michael; Tran, Van Dinh; Backofen, Rolf

Uhl, Michael; Tran, Van Dinh; Backofen, Rolf.

Afiliación

Uhl M; Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, Freiburg, 79110, Germany.
Tran VD; Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, Freiburg, 79110, Germany.
Backofen R; Bioinformatics Group, Department of Computer Science, University of Freiburg, Georges-Köhler-Allee 106, Freiburg, 79110, Germany. backofen@informatik.uni-freiburg.de.

BMC Genomics ; 21(1): 894, 2020 Dec 17.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33334306

Asunto(s)

Secuenciación de Inmunoprecipitación de Cromatina; Análisis de Datos; Sitios de Unión; Genoma; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Proteínas de Unión al ARN/genética; Proteínas de Unión al ARN/metabolismo; Análisis de Secuencia de ARN

Palabras clave

CLIP-seq; Peak calling; RBP binding site prediction; eCLIP

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Análisis de Datos / Secuenciación de Inmunoprecipitación de Cromatina Idioma: En Revista: BMC Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

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