Identification of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Outbreaks Using Whole Genome Sequencing.

Bletz, Stefan; Mellmann, Alexander; Middendorf-Bauchart, Barbara

Bletz, Stefan; Mellmann, Alexander; Middendorf-Bauchart, Barbara.

Afiliación

Bletz S; Institute of Hygiene and National Consulting Laboratory for Hemolytic Uremic Syndrome (HUS), University Hospital Münster, Münster, Germany.
Mellmann A; Institute of Hygiene and National Consulting Laboratory for Hemolytic Uremic Syndrome (HUS), University Hospital Münster, Münster, Germany. mellmann@uni-muenster.de.
Middendorf-Bauchart B; Institute of Hygiene and National Consulting Laboratory for Hemolytic Uremic Syndrome (HUS), University Hospital Münster, Münster, Germany.

Methods Mol Biol ; 2291: 87-97, 2021.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33704749

Asunto(s)

Biología Computacional; Brotes de Enfermedades; Infecciones por Escherichia coli; Genoma Bacteriano; Escherichia coli Shiga-Toxigénica/genética; Secuenciación Completa del Genoma; Infecciones por Escherichia coli/epidemiología; Infecciones por Escherichia coli/genética; Humanos

Palabras clave

Outbreak; STEC; Shiga toxin-producing Escherichia coli; Subtyping; WGS; Whole genome sequencing

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Brotes de Enfermedades / Genoma Bacteriano / Biología Computacional / Infecciones por Escherichia coli / Escherichia coli Shiga-Toxigénica / Secuenciación Completa del Genoma Tipo de estudio: Diagnostic_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Alemania

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