Genome-wide analyses of XRN1-sensitive targets in osteosarcoma cells identify disease-relevant transcripts containing G-rich motifs.

Pashler, Amy L; Towler, Benjamin P; Jones, Christopher I; Haime, Hope J; Burgess, Tom; Newbury, Sarah F

Pashler, Amy L; Towler, Benjamin P; Jones, Christopher I; Haime, Hope J; Burgess, Tom; Newbury, Sarah F.

Afiliación

Pashler AL; Brighton and Sussex Medical School, University of Sussex, Brighton, BN1 9PS, United Kingdom.
Towler BP; Brighton and Sussex Medical School, University of Sussex, Brighton, BN1 9PS, United Kingdom.
Jones CI; Brighton and Sussex Medical School, University of Sussex, Brighton, BN1 9PS, United Kingdom.
Haime HJ; Brighton and Sussex Medical School, University of Sussex, Brighton, BN1 9PS, United Kingdom.
Burgess T; Brighton and Sussex Medical School, University of Sussex, Brighton, BN1 9PS, United Kingdom.
Newbury SF; Brighton and Sussex Medical School, University of Sussex, Brighton, BN1 9PS, United Kingdom.

RNA ; 27(10): 1265-1280, 2021 10.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-34266995

Asunto(s)

Neoplasias Óseas/genética; Exorribonucleasas/genética; Proteínas Asociadas a Microtúbulos/genética; Osteosarcoma/genética; ARN Largo no Codificante/genética; ARN Mensajero/genética; ARN Neoplásico/genética; Neoplasias Óseas/metabolismo; Neoplasias Óseas/patología; Línea Celular Tumoral; Niño; Biología Computacional; Exorribonucleasas/deficiencia; Regulación Neoplásica de la Expresión Génica; Técnicas de Silenciamiento del Gen; Estudio de Asociación del Genoma Completo; Humanos; Proteínas Asociadas a Microtúbulos/deficiencia; Anotación de Secuencia Molecular; Motivos de Nucleótidos; Osteosarcoma/metabolismo; Osteosarcoma/patología; Procesamiento Postranscripcional del ARN; Estabilidad del ARN; ARN Largo no Codificante/metabolismo; ARN Mensajero/metabolismo; ARN Neoplásico/metabolismo

Palabras clave

Ewing sarcoma; RNA degradation; RNA-seq; XRN1; lncRNAs

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Texto completo: 1 Bases de datos: MEDLINE Asunto principal: Neoplasias Óseas / ARN Mensajero / ARN Neoplásico / Osteosarcoma / Exorribonucleasas / ARN Largo no Codificante / Proteínas Asociadas a Microtúbulos Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Prognostic_studies Límite: Child / Humans Idioma: En Revista: RNA Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Reino Unido

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